Вопросы вирусологии. 2019; 64: 79-89
МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ВАРИАНТОВ ВИЧ-1, ВЫДЕЛЕННЫХ В СУБЪЕКТАХ ДАЛЬНЕВОСТОЧНОГО ФЕДЕРАЛЬНОГО ОКРУГА
Котова В. О., Троценко О. Е., Балахонцева Л. А., Базыкина Е. А.
https://doi.org/10.18821/0507-4088-2019-64-2-79-89Аннотация
Введение. Молекулярно-генетический мониторинг, включающий слежение за циркуляцией резистентных форм вируса иммунодефицита человека (ВИЧ) и анализ территориальной специфики распространения различных геновариантов вируса, является важной частью системы эпидемиологического надзора за распространением ВИЧ-инфекции. Цель исследования - проанализировать распространённость вариантов ВИЧ-1 среди ВИЧ-инфицированных пациентов, проживающих на территориях Дальневосточного федерального округа (ДФО). Материал и методы. Молекулярно-генетическим анализом фрагмента области гена pol, кодирующей протеазу и часть обратной транскриптазы, охвачено 206 образцов плазмы крови от ВИЧ-инфицированных пациентов, проживающих на территории Сахалинской, Магаданской, Амурской, Еврейской автономной областей, Хабаровского края, Республики Саха (Якутия) и Чукотского автономного округа, входящих в ДФО. Результаты. Установлено, что в большинстве регионов доминирует ВИЧ-1 суб-субтипа А6, на долю которого пришлось 72,1 ± 3,1%. В 14 (6,8 ± 1,8%) случаях был выявлен субтип В и у 4 (1,9±1,0%) пациентов субтип С. На отдельных территориях обнаружены рекомбинантные формы ВИЧ-1 и определён их спектр. Выявлено 5 типов циркулирующих рекомбинантных форм ВИЧ-1: CRF03_AB - 2 (0,9 ± 0,7%), CRF02_AG - 8 (3,9 ± 1,3%), CRF63_02A1 - 27 (13,1 ± 2,4%), CRF11_cpx - 1 (0,5 ± 0,5%), CRF01_AE - 3 (1,5 ±0,8 %). Высокая гетерогенность вируса отмечена в Еврейской автономной области. Обсуждение. Проведённые исследования выявили генетические различия в пейзаже циркулирующих субтипов ВИЧ-1 и частоте распространения рекомбинантных форм ВИЧ-1. Вероятно, это объясняется увеличением миграционных потоков, которые могут способствовать трансграничному завозу и дальнейшему распространению различных генетических вариантов ВИЧ-1 среди населения ДФО. Заключение. Проведенные исследования показали, что молекулярно-генетический мониторинг циркуляции геновариантов ВИЧ-1 должен охватывать не только неблагополучные по ВИЧ-инфекции территории РФ, но и регионы с низкими показателями заболеваемости и поражённости населения.
Problems of Virology. 2019; 64: 79-89
MOLECULAR GENETIC CHARACTERISTICS OF HIV-1 VARIANTS ISOLATED IN THE SUBJECTS OF THE RUSSIAN FAR EAST
Kotova V. O., Trotsenko O. E., Balakhontseva L. A., Bazykina E. A.
https://doi.org/10.18821/0507-4088-2019-64-2-79-89Abstract
Introduction. Molecular-genetic monitoring of human immunodeficiency virus (HIV) drug-resistant strains circulation as well as analysis of territorial peculiarities of different genetic variants prevalence of the virus is a crucial part of epidemiological surveillance over HIV-infection spread. Objective of the research - to analyze the prevalence of HIV-1 genetic variants among HIV-positive people living in different constituent entities of the Far Eastern Federal District. Material and methods. Molecular-genetic analysis of the Pol-gene that is coding protease and a part of reverse transcriptase of HIV-1 was performed for a total number of 206 blood plasma samples. The biological material was collected from HIV-positive people living in Sakhalin, Magadan and Amur regions, Jewish Autonomous District, Khabarovsk region, Republic of Sakha (Yakutia) and Chukotka Autonomous Region (constituent entities of the Russian Federation in the Russian Far East). Results. The research demonstrated that HIV-1 sub-subtype A6 continues to be dominant and comprises 72.1±3.1% of all isolated subtypes in the regions of the Russian Far East. HIV-1 subtype B was identified in 14 cases (6.8±1.8%) and subtype C in 4 cases (1.9±1.0%). Spectrum of HIV-1 recombinant forms was determined for some regions. We identified five types of HIV-1 circulating recombinant forms (CRF): CRF03_AB - 2 (0.9±0.7%), CRF02_AG - 8 (3.9±1.3%), CRF63_02A1 - 27 (13.1±2.4%), CRF11_cpx - 1 (0.5±0.5%), CRF01_AE - 3 (1.5±0.8%). High heterogeneity of the virus was registered in the Jewish Autonomous District. Discussion. The conducted research revealed genetic differences in the landscape of HIV-1 subtypes circulation as well as differences in HIV-1 recombinant forms distribution frequency in the Russian Far East. Current findings are due to expansion of migration flows that promote cross-border importation and further spread of different HIV-1 genetic variants among population of the Far Eastern Federal District. Conclusion. The conducted research revealed that the molecular-genetic monitoring of HIV-1 genovariants should involve not only regions with high HIV-abundance but also with low HIV-prevalence and incidence.
Презентация платформыСкачать
Календарь образовательной программыПодробнее
События
-
Журнал «Концепт: Философия, религия, культура» принят в Scopus >>>
9 июл 2025 | 13:25 -
К платформе Elpub присоединился журнал «The BRICS Health Journal» >>>
10 июн 2025 | 12:52 -
Журнал «Неотложная кардиология и кардиоваскулярные риски» присоединился к Elpub >>>
6 июн 2025 | 09:45 -
К платформе Elpub присоединился «Медицинский журнал» >>>
5 июн 2025 | 09:41 -
НЭИКОН принял участие в конференции НИИ Организации здравоохранения и медицинского менеджмента >>>
30 мая 2025 | 10:32
Почему сайт важен для научного журнала Подробнее