Вопросы вирусологии. 2019; 64: 221-228
Результаты обследования клещей в дельте Волги (Астраханская область, 2017 год) на вирус Крымской-Конго геморрагической лихорадки (Nairoviridae, Orthonairovirus, CCHFV) и другие клещевые арбовирусы
https://doi.org/10.36233/0507-4088-2019-64-5-221-228Аннотация
Введение. В дельте Волги (Астраханская область) расположены активные природные очаги Крымской-Конго геморрагической лихорадки (ККГЛ), основным переносчиком которой служат клещи Hyalomma marginatum. Также здесь выявлена активная циркуляция вируса Дхори (Thogotovirus: Orthomyxoviridae). Вместе с тем, можно предположить, что в дельте Волги возможна циркуляция и других клещевых арбовирусов. В частности тех, которые циркулируют в соседних регионах и переносятся клещами Hyalomma spp. и Dermacenter spp., таких как вирусы Бханджа (Phlebovirus: Phenuiviridae), Вад Медани (Orbivirus: Reoviridae) и Тамды (Orthonairovirus: Nairoviridae).
Цель работы – исследование иксодовых клещей, распространённых в дельте Волги, на наличие клещевых арбовирусов, включая вирус ККГЛ и малоизученные вирусы Дхори, Бханджа, Вад Медани, и Тамды.
Материал и методы. Использовали молекулярно-генетические методы выявления и анализа нуклеиновых кислот (ПЦР, секвенирование, филогенетический анализ).
Результаты и обсуждение. В 2017 г. заражённость клещей H. marginatum вирусами ККГЛ и Дхори в дельте Волги составила 1,98 и 0,4% соответственно. Результаты генетического анализа показали, что циркулирующая здесь популяция вируса Дхори гомогенна (99–100% по гену М) и формирует отдельный генетический кластер, для которого вирус Баткен (антигенный вариант вируса Дхори) из Средней Азии является ближайшей внешней группой. В то же время вирусов Бханджа, Вад Медани и Тамды в клещах H. marginatum и D. marginatus, распространённых в данном регионе, не выявлено.
Заключение. Вирус Дхори активно циркулирует в природных очагах ККГЛ в дельте Волги. Впервые получены количественные показатели соотношения заражённости вирусами ККГЛ и Дхори клещей H. marginatum.
Список литературы
1. Зимина Ю.В., Куликова Л.Н., Салько В.Н., Ковтунов А.И. Иксодовые клещи в Астраханской области, их роль в формировании природных очагов и передаче арбовирусов человеку. В кн.: Вопросы риккетсиологии и вирусологии (Сбориник научных трудов). Астрахань-Москва; 1996: 58-62.
2. Зимина Ю.В., Бируля Н.Б., Березин В.В. Материалы зоолого-паразитологической характеристики Крымской геморрагической лихорадки в Астраханской области. В кн.: Труды Института полиомиелита и вирусных энцефалитов. Том 7. М.; 1965: 288-395.
3. Вакалова Е.В., Волынкина А.С., Котенев Е.С., Куликова Л.Н., Викторова Н.В. Детекция и генетическая характеристика РНК-изолятов вируса Крымской-Конго геморрагической лихорадки, выделенных из клещей Hyalomma marginatum в Астраханской области (2016 г.). Эпидемиология и инфекционные болезни. 2017; 22(5): 248-53. Doi: https://doi.org/10.1882/1560-9529-2017-22-5-248-253
4. Смирнова С.Е., Карань Л.С., Колесникова Н.М., Рыбкин В.С., Платонов А.Е. Распространение вируса Баткен/Дхори в эндемичной по Крымской-Конго геморрагической лихорадке Астраханской области РФ. Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. 2011; (1): 12.
5. Львов Д.Н., Джаркенов А.Ф., Аристова В.А., Ковтунов А.И., Громашевский В.Л., Вышемирский О.И. и др. Изоляция вирусов Дхори (Orthomyxoviridae, Thogotovirus) и Крымской-Конго геморрагической лихорадки (Bunyaviridae, Nairovirus) от зайца (Lepus europaeus) и собранных с него клещей Hyalomma marginatus в средней зоне дельты Волги, Астраханская область, 2001 г. Вопросы вирусологии. 2002; 47(4): 32-6.
6. Бутенко А.М., Чумаков В.М. Выделение нового для СССР арбовируса «Астра» из клещей H. plumbeum и комаров An. hyrcanus в Астраханской области. В кн.: Вопросы медицинской вирусологии. Часть 2. М.; 1971: 11-112.
7. Бутенко А.М., Лещинская Е.В., Семашко И.В., Донец М.А., Мартьянова Л.И. Вирус Дхори — возбудитель заболевания человека, пять случаев лабораторной инфекции. Вопросы вирусологии. 1987; 32(6): 724-9.
8. Shah K.V., Work T.H. Bhanja virus: a new arbovirus from ticks Haemaphysalis intermedia Warburton and Nuttall, 1909, in Orissa, India. Indian J. Med. Res. 1969; 57(5): 793-8.
9. Verani P., Balducci M., Lopes M.C., Sacca G. Isolation of Bhanja virus from Haemaphysalis ticks in Italy. Am. J. Trop. Med. Hyg. 1970; 19(1): 103-5. Doi: https://doi.org/10.4269/ajtmh.1970.19.103
10. Vesenjak-Hirjan J., Calisher C.H., Brudnjak Z., Tovornik D., Skrtic N., Lazuick J.S. Isolation of Bhanja virus from ticks in Yugoslavia. Am. J. Trop. Med. Hyg. 1977; 26(5 Pt. 1): 1003-8. Doi: https://doi.org/10.4269/ajtmh.1977.26.1003
11. Ungureanu A., Popovici V., Cătănaş F., Ioniţă I., Tutoveanu A., Safta M. Isolation of Bhanja virus in Romania. Arch. Roum. Pathol. Exp. Microbiol. 1990; 49(2): 139-45.
12. Pavlov P., Rosický B., Hubálek Z., Daniel M., Bárdos V., Minár J., et al. Isolation of Bhanja virus from ticks of the genus Haemaphysalis in southeast Bulgaria and presence of antibodies in pastured sheep. Folia Parasitol. (Praha). 1978; 25(1): 67-73.
13. Filipe A.R., Alves M.J., Karabatsos N., de Matos A.P., Nuncio M.S., Bacellar F. Palma virus, a new bunyaviridae isolated from ticks in Portugal. Intervirology. 1994; 37(6): 348-51. Doi: https://doi.org/10.1159/000150399
14. Hubálek Z. Geographic distribution of Bhanja virus. Folia Parasitol. (Praha). 1987; 34(1): 77-86.
15. Lvov D.K., Gromashevsky V.L., Zakaryan V.A., Skvortsova T.M., Berezina L.K., Gofman Y.P., et al. Razdan virus, a new ungrouped bunyavirus isolated from Dermacentor marginatus ticks in Armenia. Acta Virol. 1978; 22(6): 506-8.
16. Mádr V., Hubálek Z., Zendulková D. Experimental infection of sheep with Bhanja virus. Folia Parasitol. (Praha). 1984; 31(1): 79-84.
17. Calisher C.H., Goodpasture H.C. Human infection with Bhanja virus. Am. J. Trop. Med. Hyg. 1975; 24(6 Pt. 1): 1040-2. Doi: https://doi.org/10.4269/ajtmh.1975.24.1040
18. Punda V., Ropac D., Vesenjak-Hirjan J. Incidence of hemagglutination-inhibiting antibodies for Bhanja virus in humans along the north-west border of Yugoslavia. Zentralbl. Bakteriol. Mikrobiol. Hyg. A. 1987; 265(1-2): 227-34.
19. Азарян А.Р., Гришанова А.П., Бутенко А.М., Ларичев В.Ф., Чалов В.В., Инкина Т.Е. и др. Серологическая диагностика арбовирусных инфекций в Астраханской области. В кн.: Бутенко А.М., Баринский И.Ф., Карганова Г.Г., Малеев В.В., Терехин С.А., ред. Арбовирусы и арбовирусные инфекции. Материалы расширенного пленума проблемной комиссии «Арбовирусы» и научно-практической конференции «Арбовирусы и арбовирусные инфекции». М.: Гриф и К; 2007: 115-9.
20. Альховский С.В., Львов Д.К., Щелканов М.Ю., Щетинин А.М., Дерябин П.Г., Гительман А.К. и др. Генетическая характеристика вируса Вад Медани (WMV - Wad Medani virus) (Reoviridae, Orbivirus), изолированного в Туркмении, Казахстане и Армении из иксодовых клещей Hyalomma asiaticum Schulze et Schlottke, 1930 и в Таджикистане из H. anatolicum Koch, 1844 (Ixodidae: Hyalomminae). Вопросы вирусологии. 2014; 59(4): 25-30.
21. Lvov D.K., Sidorova G.A., Gromashevsky V.L., Kurbanov M., Skvoztsova L.M., Gofman Y.P., et al. Virus “Tamdy” – a new arbovirus, isolated in the Uzbee S.S.R. and Turkmen S.S.R. from ticks Hyalomma asiaticum asiaticum Schulee et Schlottke, 1929, and Hyalomma plumbeum plumbeum Panzer, 1796. Arch. Virol. 1976; 51(1-2): 15-21. Doi: https://doi.org/10.1007/bf01317830
22. Brinkmann A., Dincer E., Polat C., Hekimoglu O., Hacioglu S., Foldes K., et al. A metagenomic survey identifies Tamdy orthonairovirus as well as divergent phlebo-, rhabdo-, chu- and flavi-like viruses in Anatolia, Turkey. Ticks Tick Borne Dis. 2018; 9(5): 1173-83. Doi: https://doi.org/10.1016/j.ttbdis.2018.04.017
23. Львов Д.К. Лихорадка Тамды. В кн.: Львов Д.К., ред. Руководство по вирусологии. Вирусы и вирусные инфекции человека и животных. М.: МИА; 2013: 783-5.
24. Liu X., Zhang X., Wang Z., Dong Z., Xie S., Jiang M., et al. A Tentative Tamdy Orthonairovirus Related to Febrile Illness in Northwestern China. Clin. Infect. Dis. 2019; pii: ciz602. Doi: https://doi.org/10.1093/cid/ciz602
25. Chomczynski P., Sacchi N. Single-step method of RNA isolation by acid guanidinium thiocyanate-phenol-chloroform extraction. Anal. Biochem. 1987; 162(1): 156-9. Doi: https://doi.org/10.1006/abio.1987.9999
26. Альховский С.В., Львов Д.К., Щелканов М.Ю., Щетинин А.М., Дерябин П.Г., Львов Д.Н. и др. Генетическая характеристика вируса Баткен (BKNV-Batken virus) (Orthomyxoviridae, Thogotovirus), изолированного из иксодовых клещей Hyalomma marginatum Koch, 1844 и комаров Aedes caspius Pallas, 1771 и Culex hortensis Ficalbi, 1889 в Средней Азии. Вопросы вирусологии. 2014; 59(2): 33-7.
27. Львов Д.К., Альховский С.В., Щелканов М.Ю., Щетинин А.М., Аристова В.А., Гительман А.К. и др. Таксономия ранее негруппированного вируса Тамды (TAMV – Tamdy virus) (Bunyaviridae, Nairovirus), изолированного от иксодовых клещей Hyalomma asiaticum asiaticum Schülce et Schlottke, 1929 (Ixodidae, Hyalomminae) в Средней Азии и Закавказье. Вопросы вирусологии. 2014; 59(2): 15-22.
28. Lvov D.K., Karas F.R., Tsyrkin Y.M., Vargina S.G., Timofeev E.M., Osipova N.Z., et al. Batken virus, a new arbovirus isolated from ticks and mosquitoes in Kirghiz S.S.R. Arch. Gesamte Virusforsch. 1974; 44(1): 70-3. Doi: https://doi.org/10.1007/bf01242183
29. Lukashev A.N., Deviatkin A.A. Phylodynamics of Crimean Congo hemorrhagic fever virus in South Russia. Infect. Genet. Evol. 2018; 59: 23-7. Doi: https://doi.org/10.1016/j.meegid.2018.01.016
Problems of Virology. 2019; 64: 221-228
Results of investigation of ticks in Volga river delta (Astrakhan region, 2017) for Crimean-Congo hemorrhagic fever virus (Nairoviridae, Orthonairovirus, CCHFV) and other tick-borne arboviruses
https://doi.org/10.36233/0507-4088-2019-64-5-221-228Abstract
Introduction. There are natural foci of Crimean-Congo hemorrhagic fever (CCHF) that vectored by Hyalomma marginatum ticks in Volga river delta (Astrakhan region, South of Russia). The circulation of Dhori virus (DHOV) (Thogotovirus: Orthomyxoviridae) has been also shown here. We hypothesized that other tick-borne arboviruses are also likely to circulate in the region. In particular, Bhanja virus (Phlebovirus: Phenuiviridae), Wad Medani virus (Orbivirus: Reoviridae), and Tamdy virus (Orthonairovirus: Nairoviridae), which were found to circulate in neighboring regions and are vectored by Haemaphysalis spp., Dermacenter spp., and Hyalomma spp. ticks.
Goals and objectives. The aim of the study was to examine ixodid ticks in Volga river delta for the presence of CCHFV, DHOV, Bhanja virus, Wad Medani virus, and Tamdy virus.
Material and methods. Ticks were collected in Volga river delta in 2017. We used molecular genetic methods for the detection and analysis of nucleic acids (PCR, sequencing, phylogenetic analysis).
Results. We detect CCHFV and DHOV RNA in H. marginatum ticks. The rate of infected H. marginatum ticks was 1.98% for CCHFV and 0.4% for DHOV. The results of genetic analysis showed that found DHOV strains are almost identical (99- 100% in the M gene) and forms a separate genetic lineage alongside of Batken virus from Central Asia. At the same time, Bhanja virus, Wad Medani virus, and Tamdy virus were not found in ticks, collected in this region.
Conclusions. DHOV is circulating in the natural foci of CCHF in the Volga river delta. The ratio of infection of H. marginatum with CCHFV and DHOV was determined for the first time.
References
1. Zimina Yu.V., Kulikova L.N., Sal'ko V.N., Kovtunov A.I. Iksodovye kleshchi v Astrakhanskoi oblasti, ikh rol' v formirovanii prirodnykh ochagov i peredache arbovirusov cheloveku. V kn.: Voprosy rikketsiologii i virusologii (Sborinik nauchnykh trudov). Astrakhan'-Moskva; 1996: 58-62.
2. Zimina Yu.V., Birulya N.B., Berezin V.V. Materialy zoologo-parazitologicheskoi kharakteristiki Krymskoi gemorragicheskoi likhoradki v Astrakhanskoi oblasti. V kn.: Trudy Instituta poliomielita i virusnykh entsefalitov. Tom 7. M.; 1965: 288-395.
3. Vakalova E.V., Volynkina A.S., Kotenev E.S., Kulikova L.N., Viktorova N.V. Detektsiya i geneticheskaya kharakteristika RNK-izolyatov virusa Krymskoi-Kongo gemorragicheskoi likhoradki, vydelennykh iz kleshchei Hyalomma marginatum v Astrakhanskoi oblasti (2016 g.). Epidemiologiya i infektsionnye bolezni. 2017; 22(5): 248-53. Doi: https://doi.org/10.1882/1560-9529-2017-22-5-248-253
4. Smirnova S.E., Karan' L.S., Kolesnikova N.M., Rybkin V.S., Platonov A.E. Rasprostranenie virusa Batken/Dkhori v endemichnoi po Krymskoi-Kongo gemorragicheskoi likhoradke Astrakhanskoi oblasti RF. Epidemiologiya i infektsionnye bolezni. Aktual'nye voprosy. 2011; (1): 12.
5. L'vov D.N., Dzharkenov A.F., Aristova V.A., Kovtunov A.I., Gromashevskii V.L., Vyshemirskii O.I. i dr. Izolyatsiya virusov Dkhori (Orthomyxoviridae, Thogotovirus) i Krymskoi-Kongo gemorragicheskoi likhoradki (Bunyaviridae, Nairovirus) ot zaitsa (Lepus europaeus) i sobrannykh s nego kleshchei Hyalomma marginatus v srednei zone del'ty Volgi, Astrakhanskaya oblast', 2001 g. Voprosy virusologii. 2002; 47(4): 32-6.
6. Butenko A.M., Chumakov V.M. Vydelenie novogo dlya SSSR arbovirusa «Astra» iz kleshchei H. plumbeum i komarov An. hyrcanus v Astrakhanskoi oblasti. V kn.: Voprosy meditsinskoi virusologii. Chast' 2. M.; 1971: 11-112.
7. Butenko A.M., Leshchinskaya E.V., Semashko I.V., Donets M.A., Mart'yanova L.I. Virus Dkhori — vozbuditel' zabolevaniya cheloveka, pyat' sluchaev laboratornoi infektsii. Voprosy virusologii. 1987; 32(6): 724-9.
8. Shah K.V., Work T.H. Bhanja virus: a new arbovirus from ticks Haemaphysalis intermedia Warburton and Nuttall, 1909, in Orissa, India. Indian J. Med. Res. 1969; 57(5): 793-8.
9. Verani P., Balducci M., Lopes M.C., Sacca G. Isolation of Bhanja virus from Haemaphysalis ticks in Italy. Am. J. Trop. Med. Hyg. 1970; 19(1): 103-5. Doi: https://doi.org/10.4269/ajtmh.1970.19.103
10. Vesenjak-Hirjan J., Calisher C.H., Brudnjak Z., Tovornik D., Skrtic N., Lazuick J.S. Isolation of Bhanja virus from ticks in Yugoslavia. Am. J. Trop. Med. Hyg. 1977; 26(5 Pt. 1): 1003-8. Doi: https://doi.org/10.4269/ajtmh.1977.26.1003
11. Ungureanu A., Popovici V., Cătănaş F., Ioniţă I., Tutoveanu A., Safta M. Isolation of Bhanja virus in Romania. Arch. Roum. Pathol. Exp. Microbiol. 1990; 49(2): 139-45.
12. Pavlov P., Rosický B., Hubálek Z., Daniel M., Bárdos V., Minár J., et al. Isolation of Bhanja virus from ticks of the genus Haemaphysalis in southeast Bulgaria and presence of antibodies in pastured sheep. Folia Parasitol. (Praha). 1978; 25(1): 67-73.
13. Filipe A.R., Alves M.J., Karabatsos N., de Matos A.P., Nuncio M.S., Bacellar F. Palma virus, a new bunyaviridae isolated from ticks in Portugal. Intervirology. 1994; 37(6): 348-51. Doi: https://doi.org/10.1159/000150399
14. Hubálek Z. Geographic distribution of Bhanja virus. Folia Parasitol. (Praha). 1987; 34(1): 77-86.
15. Lvov D.K., Gromashevsky V.L., Zakaryan V.A., Skvortsova T.M., Berezina L.K., Gofman Y.P., et al. Razdan virus, a new ungrouped bunyavirus isolated from Dermacentor marginatus ticks in Armenia. Acta Virol. 1978; 22(6): 506-8.
16. Mádr V., Hubálek Z., Zendulková D. Experimental infection of sheep with Bhanja virus. Folia Parasitol. (Praha). 1984; 31(1): 79-84.
17. Calisher C.H., Goodpasture H.C. Human infection with Bhanja virus. Am. J. Trop. Med. Hyg. 1975; 24(6 Pt. 1): 1040-2. Doi: https://doi.org/10.4269/ajtmh.1975.24.1040
18. Punda V., Ropac D., Vesenjak-Hirjan J. Incidence of hemagglutination-inhibiting antibodies for Bhanja virus in humans along the north-west border of Yugoslavia. Zentralbl. Bakteriol. Mikrobiol. Hyg. A. 1987; 265(1-2): 227-34.
19. Azaryan A.R., Grishanova A.P., Butenko A.M., Larichev V.F., Chalov V.V., Inkina T.E. i dr. Serologicheskaya diagnostika arbovirusnykh infektsii v Astrakhanskoi oblasti. V kn.: Butenko A.M., Barinskii I.F., Karganova G.G., Maleev V.V., Terekhin S.A., red. Arbovirusy i arbovirusnye infektsii. Materialy rasshirennogo plenuma problemnoi komissii «Arbovirusy» i nauchno-prakticheskoi konferentsii «Arbovirusy i arbovirusnye infektsii». M.: Grif i K; 2007: 115-9.
20. Al'khovskii S.V., L'vov D.K., Shchelkanov M.Yu., Shchetinin A.M., Deryabin P.G., Gitel'man A.K. i dr. Geneticheskaya kharakteristika virusa Vad Medani (WMV - Wad Medani virus) (Reoviridae, Orbivirus), izolirovannogo v Turkmenii, Kazakhstane i Armenii iz iksodovykh kleshchei Hyalomma asiaticum Schulze et Schlottke, 1930 i v Tadzhikistane iz H. anatolicum Koch, 1844 (Ixodidae: Hyalomminae). Voprosy virusologii. 2014; 59(4): 25-30.
21. Lvov D.K., Sidorova G.A., Gromashevsky V.L., Kurbanov M., Skvoztsova L.M., Gofman Y.P., et al. Virus “Tamdy” – a new arbovirus, isolated in the Uzbee S.S.R. and Turkmen S.S.R. from ticks Hyalomma asiaticum asiaticum Schulee et Schlottke, 1929, and Hyalomma plumbeum plumbeum Panzer, 1796. Arch. Virol. 1976; 51(1-2): 15-21. Doi: https://doi.org/10.1007/bf01317830
22. Brinkmann A., Dincer E., Polat C., Hekimoglu O., Hacioglu S., Foldes K., et al. A metagenomic survey identifies Tamdy orthonairovirus as well as divergent phlebo-, rhabdo-, chu- and flavi-like viruses in Anatolia, Turkey. Ticks Tick Borne Dis. 2018; 9(5): 1173-83. Doi: https://doi.org/10.1016/j.ttbdis.2018.04.017
23. L'vov D.K. Likhoradka Tamdy. V kn.: L'vov D.K., red. Rukovodstvo po virusologii. Virusy i virusnye infektsii cheloveka i zhivotnykh. M.: MIA; 2013: 783-5.
24. Liu X., Zhang X., Wang Z., Dong Z., Xie S., Jiang M., et al. A Tentative Tamdy Orthonairovirus Related to Febrile Illness in Northwestern China. Clin. Infect. Dis. 2019; pii: ciz602. Doi: https://doi.org/10.1093/cid/ciz602
25. Chomczynski P., Sacchi N. Single-step method of RNA isolation by acid guanidinium thiocyanate-phenol-chloroform extraction. Anal. Biochem. 1987; 162(1): 156-9. Doi: https://doi.org/10.1006/abio.1987.9999
26. Al'khovskii S.V., L'vov D.K., Shchelkanov M.Yu., Shchetinin A.M., Deryabin P.G., L'vov D.N. i dr. Geneticheskaya kharakteristika virusa Batken (BKNV-Batken virus) (Orthomyxoviridae, Thogotovirus), izolirovannogo iz iksodovykh kleshchei Hyalomma marginatum Koch, 1844 i komarov Aedes caspius Pallas, 1771 i Culex hortensis Ficalbi, 1889 v Srednei Azii. Voprosy virusologii. 2014; 59(2): 33-7.
27. L'vov D.K., Al'khovskii S.V., Shchelkanov M.Yu., Shchetinin A.M., Aristova V.A., Gitel'man A.K. i dr. Taksonomiya ranee negruppirovannogo virusa Tamdy (TAMV – Tamdy virus) (Bunyaviridae, Nairovirus), izolirovannogo ot iksodovykh kleshchei Hyalomma asiaticum asiaticum Schülce et Schlottke, 1929 (Ixodidae, Hyalomminae) v Srednei Azii i Zakavkaz'e. Voprosy virusologii. 2014; 59(2): 15-22.
28. Lvov D.K., Karas F.R., Tsyrkin Y.M., Vargina S.G., Timofeev E.M., Osipova N.Z., et al. Batken virus, a new arbovirus isolated from ticks and mosquitoes in Kirghiz S.S.R. Arch. Gesamte Virusforsch. 1974; 44(1): 70-3. Doi: https://doi.org/10.1007/bf01242183
29. Lukashev A.N., Deviatkin A.A. Phylodynamics of Crimean Congo hemorrhagic fever virus in South Russia. Infect. Genet. Evol. 2018; 59: 23-7. Doi: https://doi.org/10.1016/j.meegid.2018.01.016
