Журналов:     Статей:        

Вопросы вирусологии. 2017; 62: 11-17

Природные очаги гриппа А в Западной Арктике

Гребенникова Т. В., Сыроешкин А. В., Чичаева М. А., Эспер С. А., Львов Д. К.

https://doi.org/10.18821/0507-4088-2017-62-1-11-17

Аннотация

Исследованы малые бухты птичьих арктических базаров Кольского полуострова (побережье Баренцева моря). Показано, что в бухтах под птичьим базаром в поверхностном микрослое (ПМС) и образцах аэрозоля обнаружена РНК вируса гриппа А. Проведено секвенирование нуклеотидных последовательностей гриппа в составе ПМС и аэрозоля, первичная структура фрагментов подтвердила их идентичность в ПМС и морском аэрозоле. Предложен механизм переноса вирусов по пути поверхностный микрослой - морской аэрозоль. Составлена кинетическая схема взаимодействия вирус - хозяин - биоценоз, позволяющая математически моделировать численность вирусной популяции в зависимости от температуры.
Список литературы

1. L’vov D.K., Shchelkanov M.Yu., Prilipov A.G., Vlasov N.A., Fedyakina I.T., Deryabin P.G. et al. Evolution of HPAI H5N1 virus in Natural ecosystems of Northern Eurasia (2005-2008). Avian Dis. 2010; (54): 483-95.

2. Львов Д.К., Бурцева Е.И., Щелканов М.Ю., Прилипов А.Г., Колобухина Л.В., Малышев Н.А. и др. Распространение нового пандемического вируса гриппа А (H1N1)v в России. Вопросы вирусологии. 2010; 54 (3): 4-9.

3. Qureshi A., MacLeod M., Hungerbühler K. Modeling aerosol suspension from soils and oceans as sources of micropollutants to air. Chemosphere. 2009; 77(4): 495-500.

4. Bac V.T., Hien P.D. Regional and local emissions in red river delta, Northern Vietnam. Air Qual. Atmos. Health. 2009; 2(3): 157-67.

5. Psillakis E., Cheng J., Hoffmann M.R., Colussi A.J. Enrichment factors of perfluoroalkyl oxoanions at the air/water interface. J. Phys. Chem. A. 2009; 113(31): 8826-9.

6. Fleming L.E., Bean J.A., Kirkpatrick B., Cheng Y.S., Pierce R., Naar J. et al. Exposure and effect assessment of aerosolized red tide toxins (brevetoxins) and asthma. Environ. Health Perspect. 2009; 117(7): 1095-100.

7. García-Flor N., Dachs J., Bayona J.M., Albaigés J. Surface waters are a source of polychlorinated biphenyls to the coastal atmosphere of the North-Western Mediterranean Sea. Chemosphere. 2009; 75(9): 1144-52.

8. Paytan A., Mackey K.R., Chen Y., Lima I.D., Doney S.C., Mahowald N. et al. Toxicity of atmospheric aerosols on marine phytoplankton. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2009; 106(12): 4601-5.

9. Horemans B., Krata A., Buczynska A.J., Dirtu A.C., Van Meel K., Van Grieken R. et al. Major ionic species in size-segregated aerosols and associated gaseous pollutants at a coastal site on the Belgian North Sea. J. Environ. Monit. 2009; 11(3): 670-7.

10. Procedure for sampling the sea-surface microlayer. Intergovernmental Oceanographic Commissions. Manuals and Guides. Vol. 15. UNESCO; 1985.

11. Goncharuk V.V., Lapshin V.B., Chichaeva M.A., Matveeva I.S., Samsoni-Todorov A.O., Taranov V.V. et al. Heavy metals, aluminum, and arsenic in aerosols of the world ocean. J. Water Chem. Technol. 2012: 34(1): 1-10.

12. Киреев Д.Е., Аканина Д.С., Гребенникова Т.В., Забережный А.Д., Щелканов М.Ю., Львов Д.К. Разработка тест-систем для выявления и типирования вируса гриппа А на основе полимеразной цепной реакции. Вопросы вирусологии. 2007; 52(4): 7-22.

13. Потапова Н.И., Гребенникова Т.В., Забережный А.Д., Краснова М.А., Скотникова О.И., Алипер Т.И. и др. Разработка тест-системы на основе полимеразной цепной реакции (ПЦР) в реальном времени для дифференциальной диагностики микобактерий. Вестник Российского Университета Дружбы Народов. 2004; 28(4): 300-8.

14. Desboeufs K.V., Sofikitis A., Losno R., Colin J.L., Ausset P. Dissolution and solubility of trace metals from natural and anthropogenic aerosol particulate matter. Chemosphere. 2005; 58(2): 195-203.

15. Deane G.B., Stokes M.D. Scale dependence of bubble creation mechanisms in breaking waves. Nature. 2002; 418(6900): 839-44.

16. Лесников Е.В., Чичаева М.А., Лапшин В.Б., Гребенникова Т.В., Сыроешкин А.В. Биоаэрозоль атлантического океана и способ мониторинга аэрозоля в нанодиапазоне размерностей. Естественные и технические науки. 2010; (5): 349-55.

17. Goncharuk V.V., Samsoni-Todorov A.O., Taranov V.V., Lapshin V.B., Chichaeva M.A., Syroeshkin A.V. et al. The system of the efficient monitoring of air quality in maritime cities and health resort areas: Pollution of the nearwater layer of the atmosphere with sea aerosols. J. Water Chem. Technol. 2012; 34(2): 79-87.

18. Kimura K., Tomaru Y. Isolation and characterization of a single-stranded DNA virus infecting the marine diatom Chaetoceros sp. strain SS628-11 isolated from western Japan. PLoS One. 2013; 8(12): e82013.

19. Mizuno C.M., Rodriguez-Valera F., Kimes N.E., Ghai R. Expanding the marine virosphere using metagenomics. PLoS Genet. 2013; 9(12): e1003987.

20. Martínez J.M., Swan B.K., Wilson W.H. Marine viruses, a genetic reservoir revealed by targeted viromics. ISME J. 2014; 8(5): 1079-88.

Problems of Virology. 2017; 62: 11-17

Influenza A virus in the Western Arctic

Grebennikova T. V., Syroeshkin A. V., Chichaeva M. A., Esper S. A., Lvov D. K.

https://doi.org/10.18821/0507-4088-2017-62-1-11-17

Abstract

Small bays of bird bazaars of the Arctic Kola Peninsula (Barents Sea) have been studied. RNA of influenza A virus was found in the surface microlayer (SM) and aerosol samples from the bays located beneath bird colonies. The nucleotide sequencing of the PCR fragments from the SM and the sea aerosol showed their identity for each bay. Virus transfer mechanism along the “surface microlayer - sea aerosol” path has been proposed. The kinetic scheme of the virus-host-environment interaction, which allows the dependence of the viral population size on the temperature to be simulated, has been developed.
References

1. L’vov D.K., Shchelkanov M.Yu., Prilipov A.G., Vlasov N.A., Fedyakina I.T., Deryabin P.G. et al. Evolution of HPAI H5N1 virus in Natural ecosystems of Northern Eurasia (2005-2008). Avian Dis. 2010; (54): 483-95.

2. L'vov D.K., Burtseva E.I., Shchelkanov M.Yu., Prilipov A.G., Kolobukhina L.V., Malyshev N.A. i dr. Rasprostranenie novogo pandemicheskogo virusa grippa A (H1N1)v v Rossii. Voprosy virusologii. 2010; 54 (3): 4-9.

3. Qureshi A., MacLeod M., Hungerbühler K. Modeling aerosol suspension from soils and oceans as sources of micropollutants to air. Chemosphere. 2009; 77(4): 495-500.

4. Bac V.T., Hien P.D. Regional and local emissions in red river delta, Northern Vietnam. Air Qual. Atmos. Health. 2009; 2(3): 157-67.

5. Psillakis E., Cheng J., Hoffmann M.R., Colussi A.J. Enrichment factors of perfluoroalkyl oxoanions at the air/water interface. J. Phys. Chem. A. 2009; 113(31): 8826-9.

6. Fleming L.E., Bean J.A., Kirkpatrick B., Cheng Y.S., Pierce R., Naar J. et al. Exposure and effect assessment of aerosolized red tide toxins (brevetoxins) and asthma. Environ. Health Perspect. 2009; 117(7): 1095-100.

7. García-Flor N., Dachs J., Bayona J.M., Albaigés J. Surface waters are a source of polychlorinated biphenyls to the coastal atmosphere of the North-Western Mediterranean Sea. Chemosphere. 2009; 75(9): 1144-52.

8. Paytan A., Mackey K.R., Chen Y., Lima I.D., Doney S.C., Mahowald N. et al. Toxicity of atmospheric aerosols on marine phytoplankton. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2009; 106(12): 4601-5.

9. Horemans B., Krata A., Buczynska A.J., Dirtu A.C., Van Meel K., Van Grieken R. et al. Major ionic species in size-segregated aerosols and associated gaseous pollutants at a coastal site on the Belgian North Sea. J. Environ. Monit. 2009; 11(3): 670-7.

10. Procedure for sampling the sea-surface microlayer. Intergovernmental Oceanographic Commissions. Manuals and Guides. Vol. 15. UNESCO; 1985.

11. Goncharuk V.V., Lapshin V.B., Chichaeva M.A., Matveeva I.S., Samsoni-Todorov A.O., Taranov V.V. et al. Heavy metals, aluminum, and arsenic in aerosols of the world ocean. J. Water Chem. Technol. 2012: 34(1): 1-10.

12. Kireev D.E., Akanina D.S., Grebennikova T.V., Zaberezhnyi A.D., Shchelkanov M.Yu., L'vov D.K. Razrabotka test-sistem dlya vyyavleniya i tipirovaniya virusa grippa A na osnove polimeraznoi tsepnoi reaktsii. Voprosy virusologii. 2007; 52(4): 7-22.

13. Potapova N.I., Grebennikova T.V., Zaberezhnyi A.D., Krasnova M.A., Skotnikova O.I., Aliper T.I. i dr. Razrabotka test-sistemy na osnove polimeraznoi tsepnoi reaktsii (PTsR) v real'nom vremeni dlya differentsial'noi diagnostiki mikobakterii. Vestnik Rossiiskogo Universiteta Druzhby Narodov. 2004; 28(4): 300-8.

14. Desboeufs K.V., Sofikitis A., Losno R., Colin J.L., Ausset P. Dissolution and solubility of trace metals from natural and anthropogenic aerosol particulate matter. Chemosphere. 2005; 58(2): 195-203.

15. Deane G.B., Stokes M.D. Scale dependence of bubble creation mechanisms in breaking waves. Nature. 2002; 418(6900): 839-44.

16. Lesnikov E.V., Chichaeva M.A., Lapshin V.B., Grebennikova T.V., Syroeshkin A.V. Bioaerozol' atlanticheskogo okeana i sposob monitoringa aerozolya v nanodiapazone razmernostei. Estestvennye i tekhnicheskie nauki. 2010; (5): 349-55.

17. Goncharuk V.V., Samsoni-Todorov A.O., Taranov V.V., Lapshin V.B., Chichaeva M.A., Syroeshkin A.V. et al. The system of the efficient monitoring of air quality in maritime cities and health resort areas: Pollution of the nearwater layer of the atmosphere with sea aerosols. J. Water Chem. Technol. 2012; 34(2): 79-87.

18. Kimura K., Tomaru Y. Isolation and characterization of a single-stranded DNA virus infecting the marine diatom Chaetoceros sp. strain SS628-11 isolated from western Japan. PLoS One. 2013; 8(12): e82013.

19. Mizuno C.M., Rodriguez-Valera F., Kimes N.E., Ghai R. Expanding the marine virosphere using metagenomics. PLoS Genet. 2013; 9(12): e1003987.

20. Martínez J.M., Swan B.K., Wilson W.H. Marine viruses, a genetic reservoir revealed by targeted viromics. ISME J. 2014; 8(5): 1079-88.