Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2021; 98: 18-27
Выявление мутаций лекарственной устойчивости вируса гепатита С у пациентов с неэффективной терапией препаратами прямого противовирусного действия
Валутите Д. Э., Семенов А. В., Останкова Ю. В., Козлов К. В., Борисов А. Г., Назаров В. Д., Тотолян А. А.
https://doi.org/10.36233/0372-9311-47Аннотация
Актуальность. Появление препаратов прямого противовирусного действия (ПППД) стало большим достижением в лечении пациентов с хроническим гепатитом С. Однако выявляются случаи отсутствия ответа на лечение. В 5% случаев наиболее вероятной причиной вирусологического прорыва являются мутации устойчивости к ПППД в геноме вируса гепатита С.
Цель работы — выявить мутации лекарственной устойчивости вируса гепатита С у пациентов с неэффективной терапией ПППД.
Материалы и методы. Материалом исследования служили образцы плазмы крови 3 пациентов с подтвержденным диагнозом хронического гепатита С с вирусологической неэффективностью терапии ПППД. Генотип всех изолятов — 1b. Применяли метод определения мутаций лекарственной устойчивости на основе прямого секвенирования генов NS3, NS5A, NS5B, разработанный в НИИЭМ им. Пастера. Результаты. Мутации лекарственной устойчивости были выявлены во всех случаях. Согласно базе данных Geno2pheno [hcv] 0.92, нуклеотидные замены были определены в разных генах вируса и, предположительно, обусловливали устойчивость или снижение чувствительности в отношении препаратов, как входящих в состав комбинированной терапии софосбувир + даклатасвир, так и отсутствующих в ней. Неэффективность терапии противовирусными препаратами у пациентов с хроническим гепатитом С обусловлена мутациями лекарственной устойчивости.
Выводы. Разработанный метод позволяет выявлять мутации лекарственной устойчивости в генах NS3, NS5A, NS5B при вирусологической неэффективности терапии ПППД.
Список литературы
1. Zabala V., Tong M., Yu R., Ramirez T., Yalcin E.B., Balbo S., et al. Potential contributions of the tobacco nicotine-derived nitrosamine ketone (NNK) in the pathogenesis of steatohepatitis in a chronic plus binge rat model of alcoholic liver disease. Alcohol Alcohol. 2015; 50(2): 118–31. https://doi.org/10.1093/alcalc/agu083
2. Bertino G., Ardiri A., Proiti M., Rigano G., Frazzetto E., Demma S., et al. Chronic hepatitis C: This and the new era of treatment. World J. Hepatol. 2016; 8(2): 92–106. https://doi.org/10.4254/wjh.v8.i2.92
3. Vogel W. Treatment of chronic hepatitis C patients not responding to combination therapy with ribavirin and interferon alpha — hype or hope? Wien. Klin. Wochenschr. 2004; 116(15-16): 508–10. https://doi.org/10.1007/bf03217702
4. Strader D.B., Seeff L.B. A brief history of the treatment of viral hepatitis C. Clin. Liver Dis. (Hoboken). 2012; 1(1): 6–11. https://doi.org/10.1002/cld.1
5. Есмембетов К.И., Есмембетова Н.И. Противовирусная терапия цирроза печени в исходе хронического гепатита С препаратами интерферона. Клиническая медицина Казахстана. 2015; (4): 21–34.
6. Koike K. Antiviral treatment of hepatitis C: present status and future prospects. J. Infect. Chemother. 2006; 12(5): 227–32. https://doi.org/10.1007/s10156-006-0460-0
7. Ивашкин В.Т., Маевская М.В., Абдурахманов Д.Т., Бакулин И.Г., Гейвандова Н.И., Зубкин М.Л. и др. Современные возможности противовирусной терапии с использованием даклатасвира при лечении больных хроническим вирусным гепатитом С: результаты программы индивидуального доступа. Российский журнал гастроэнтерологии, гепатологии, колопроктологии. 2017; 27(6): 52–62.
8. Hijikata M., Kato N., Ootsuyama Y., Nakagawa M., Shimotohno K. Gene-mapping of the putative structural region of the hepatitis C virus genome by in vitro processing analysis. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1991; 88(13): 5547–51. https://doi.org/10.1073/pnas.88.13.5547
9. Lin C., Lindenbach B.D., Pragai B.M., Mccourt D.W., Rice C.M. Processing in the hepatitis C virus E2-NS2 region: identification of p7 and 2 distinct e2-specific products with different C termini. J. Virol. 1994; 68(8): 5063–73. https://doi.org/10.1128/jvi.68.8.5063-5073.1994
10. Aghemo A., De Francesco R. New horizons in hepatitis C antiviral therapy with direct-acting antivirals. Hepatology. 2013; 58(1): 428–38. https://doi.org/10.1002/hep.26371
11. Sarrazin C., Kieffer T.L., Bartels D., Hanzelka B., Müh U., Welker M., et al. Dynamic hepatitis C virus genotypic and phenotypic changes in patients treated with the protease inhibitor telaprevir. Gastroenterology. 2007; 132(5): 1767–77. https://doi.org/10.1053/j.gastro.2007.02.037
12. Lin C., Kwong A.D., Perni R.B. Discovery and development of VX950, a novel, covalent, and reversible inhibitor of hepatitis C virus NS3.4A serine protease. Infect. Disord. Drug Targets. 2006; 6(1): 3–16. https://doi.org/10.2174/187152606776056706
13. Блохина Н.П., Малышев Н.А., Нурмухаметова Е.А. Лечение гепатита С: настоящее и будущее. Туберкулез и значимые инфекции. 2013; (1): 73–8.
14. Бурневич Э.З., Никулкина Е.Н., Филатова А.Л. Софосбувирсодержащие схемы противовирусной терапии хронического гепатита С, актуальные в Российской Федерации в 2018 г. Клиническая фармакология и терапия. 2018; 27(2): 10–7.
15. European Association for the Study of the Liver. EASL recommendations on treatment of hepatitis C 2018. J. Hepatol. 2018; 69(2): 461–511. https://doi.org/10.1016/j.jhep.2018.03.026
16. Vermehren J., Susser S., Dietz J., Von Hahn T., Petersen J., et al. Retreatment of patients who failed DAA-combination therapies: real-world experience from a large hepatitis C resistance database. Hepatology. 2016; 64(2): 188.
17. Кичатова В.С., Кюрегян К.К. Современный взгляд на резистентность к препаратам прямого противовирусного действия при лечении вирусного гепатита С. Инфекционные болезни: новости, мнения, обучение. 2019; 8(2): 64–71. https://doi.org/10.24411/2305-3496-2019-12009
18. Feld J.J. Resistance testing: Interpretation and incorporation into HCV treatment algorithms. Clin. Liver Dis. (Hoboken). 2017; 9(5): 115–20. https://doi.org/10.1002/cld.631
19. Валутите Д.Э. Апробация молекулярно-генетического метода выявления мутаций лекарственной устойчивости вируса гепатита С. В кн.: Сборник тезисов VIII международного молодежного медицинского конгресса «Санкт-Петербургские научные чтения». СПб.; 2019: 180.
20. Lawitz E., Mangia A., Wyles D., Rodriguez-Torres M., Hassanein T., Gordon S.C., et al. Sofosbuvir for previously untreated chronic hepatitis C infection. N. Engl. J. Med. 2013; 368(20): 1878–87. https://doi.org/10.1056/nejmoa1214853
21. European Association for the Study of the Liver. EASL recommendations on treatment of hepatitis C 2016. J. Hepatol. 2017; 66(1): 153–94. https://doi.org/10.1016/j.jhep.2016.09.001
22. Nitta S., Asahina Y., Matsuda M., Yamada N., Sugiyama R., Masaki T., et al. Effects of resistance-associated NS5A mutations in hepatitis C virus on viral production and susceptibility to antiviral reagents. Sci. Rep. 2016; 6: 34652. https://doi.org/10.1038/srep34652
23. Lemm J.A., O'Boyle D., Liu M., Nower P.T., Colonno R., Deshpande M.S., et al. Identification of hepatitis C virus NS5A inhibitors. J. Virol. 2010; 84(1): 482–91. https://doi.org/10.1128/jvi.01360-09
24. Charlton M., Gane E., Manns M.P., Brown R.S., Curry M.P., Kwo P.Y., et al. Sofosbuvir and ribavirin for treatment of compensated recurrent hepatitis C virus infection after liver transplantation. Gastroenterology. 2015; 148(1): 108–17. https://doi.org/10.1053/j.gastro.2014.10.001
25. Wang Y., Rao H.Y., Xie X.W., Wei L. Direct-acting antiviral agents resistance-associated polymorphisms in Сhinese treatment-naïve patients infected with genotype 1b hepatitis C virus. Chin. Med. J. (Engl). 2015; 128(19): 2625–31. https://doi.org/10.4103/0366-6999.166038
26. Amer F., Yousif M.M., Hammad N.M., Garcia-Cehic D., Gregori J., Rando-Segura A., et al. Deep-sequencing study of HCV G4a resistance-associated substitutions in Egyptian patients failing DAA treatment. Infect. Drug Resist. 2019; 12: 2799–807. https://doi.org/10.2147/idr.s214735
27. Bellocchi M.C., Aragri M., Carioti L., Fabeni L., Pipitone R.M., Brancaccio G., et al. NS5A gene analysis by next generation sequencing in HCV nosocomial transmission clusters of HCV genotype 1b infected patients. Cells. 2019; 8(7): 666. https://doi.org/10.3390/cells8070666
28. Georg von Massow G., Garcia-Cehic D., Gregori J., Rodriguez-Frias F., Macià M.D., Escarda A., et al. Whole-genome characterization and resistance-associated substitutions in a new HCV genotype 1 subtype. Infect. Drug Resist. 2019; 12: 947–55. https://doi.org/10.2147/idr.s195441
29. Семенов А.В., Останкова Ю.В., Герасимова В.В., Бичурина М.А., Козлов А.В., Мукомолов С.Л. и др. Молекулярноэпидемиологические особенности изолятов вируса гепатита c из разных регионов Республики Саха (Якутия). Инфекция и иммунитет. 2015; 5(4): 359–72.
Journal of microbiology, epidemiology and immunobiology. 2021; 98: 18-27
Detection of drug resistance mutations of hepatitis C virus in patients with failure of the treatment with direct acting antivirals
Valutite D. E., Semenov A. V., Ostankova Yu. V., Kozlov K. V., Borisov A. G., Nazarov V. D., Totolian A. A.
https://doi.org/10.36233/0372-9311-47Abstract
Background. The development of direct acting antivirals (DAAs) has spurred a revolution in treatment of patients with chronic hepatitis C. However, there are cases showing no response to treatment. In 5% of cases, the viral breakthrough is most likely caused by DAA resistance mutations in the hepatitis C virus genome.
The purpose of the study is to detect drug resistance mutations of hepatitis C virus in patients with DAA treatment failure.
Materials and methods. The study was performed on plasma samples from 3 patients diagnosed with chronic hepatitis C virus infection and demonstrating DAA virological treatment failure. All isolates had genotype 1b. Drug resistance mutations were detected by using direct sequencing of NS3, NS5A, and NS5B genome regions. The detection technique was developed at the Pasteur Research Institute of Epidemiology and Microbiology.
Results. Drug resistance mutations were detected in all cases. By using the Geno2pheno [hcv] 0.92 tool, nucleotide substitutions were detected in different viral genome regions and presumably caused resistance or decreased sensitivity to antivirals both present and absent in the sofosbuvir + daclatasvir combination therapy. Antiviral treatment failure in patients with chronic hepatitis C is caused by drug resistance mutations.
Conclusions. The developed technique is efficient for detection of drug resistance mutations in NS3, NS5A, and NS5B regions in cases of virological failure of DAA treatment.
References
1. Zabala V., Tong M., Yu R., Ramirez T., Yalcin E.B., Balbo S., et al. Potential contributions of the tobacco nicotine-derived nitrosamine ketone (NNK) in the pathogenesis of steatohepatitis in a chronic plus binge rat model of alcoholic liver disease. Alcohol Alcohol. 2015; 50(2): 118–31. https://doi.org/10.1093/alcalc/agu083
2. Bertino G., Ardiri A., Proiti M., Rigano G., Frazzetto E., Demma S., et al. Chronic hepatitis C: This and the new era of treatment. World J. Hepatol. 2016; 8(2): 92–106. https://doi.org/10.4254/wjh.v8.i2.92
3. Vogel W. Treatment of chronic hepatitis C patients not responding to combination therapy with ribavirin and interferon alpha — hype or hope? Wien. Klin. Wochenschr. 2004; 116(15-16): 508–10. https://doi.org/10.1007/bf03217702
4. Strader D.B., Seeff L.B. A brief history of the treatment of viral hepatitis C. Clin. Liver Dis. (Hoboken). 2012; 1(1): 6–11. https://doi.org/10.1002/cld.1
5. Esmembetov K.I., Esmembetova N.I. Protivovirusnaya terapiya tsirroza pecheni v iskhode khronicheskogo gepatita S preparatami interferona. Klinicheskaya meditsina Kazakhstana. 2015; (4): 21–34.
6. Koike K. Antiviral treatment of hepatitis C: present status and future prospects. J. Infect. Chemother. 2006; 12(5): 227–32. https://doi.org/10.1007/s10156-006-0460-0
7. Ivashkin V.T., Maevskaya M.V., Abdurakhmanov D.T., Bakulin I.G., Geivandova N.I., Zubkin M.L. i dr. Sovremennye vozmozhnosti protivovirusnoi terapii s ispol'zovaniem daklatasvira pri lechenii bol'nykh khronicheskim virusnym gepatitom S: rezul'taty programmy individual'nogo dostupa. Rossiiskii zhurnal gastroenterologii, gepatologii, koloproktologii. 2017; 27(6): 52–62.
8. Hijikata M., Kato N., Ootsuyama Y., Nakagawa M., Shimotohno K. Gene-mapping of the putative structural region of the hepatitis C virus genome by in vitro processing analysis. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1991; 88(13): 5547–51. https://doi.org/10.1073/pnas.88.13.5547
9. Lin C., Lindenbach B.D., Pragai B.M., Mccourt D.W., Rice C.M. Processing in the hepatitis C virus E2-NS2 region: identification of p7 and 2 distinct e2-specific products with different C termini. J. Virol. 1994; 68(8): 5063–73. https://doi.org/10.1128/jvi.68.8.5063-5073.1994
10. Aghemo A., De Francesco R. New horizons in hepatitis C antiviral therapy with direct-acting antivirals. Hepatology. 2013; 58(1): 428–38. https://doi.org/10.1002/hep.26371
11. Sarrazin C., Kieffer T.L., Bartels D., Hanzelka B., Müh U., Welker M., et al. Dynamic hepatitis C virus genotypic and phenotypic changes in patients treated with the protease inhibitor telaprevir. Gastroenterology. 2007; 132(5): 1767–77. https://doi.org/10.1053/j.gastro.2007.02.037
12. Lin C., Kwong A.D., Perni R.B. Discovery and development of VX950, a novel, covalent, and reversible inhibitor of hepatitis C virus NS3.4A serine protease. Infect. Disord. Drug Targets. 2006; 6(1): 3–16. https://doi.org/10.2174/187152606776056706
13. Blokhina N.P., Malyshev N.A., Nurmukhametova E.A. Lechenie gepatita S: nastoyashchee i budushchee. Tuberkulez i znachimye infektsii. 2013; (1): 73–8.
14. Burnevich E.Z., Nikulkina E.N., Filatova A.L. Sofosbuvirsoderzhashchie skhemy protivovirusnoi terapii khronicheskogo gepatita S, aktual'nye v Rossiiskoi Federatsii v 2018 g. Klinicheskaya farmakologiya i terapiya. 2018; 27(2): 10–7.
15. European Association for the Study of the Liver. EASL recommendations on treatment of hepatitis C 2018. J. Hepatol. 2018; 69(2): 461–511. https://doi.org/10.1016/j.jhep.2018.03.026
16. Vermehren J., Susser S., Dietz J., Von Hahn T., Petersen J., et al. Retreatment of patients who failed DAA-combination therapies: real-world experience from a large hepatitis C resistance database. Hepatology. 2016; 64(2): 188.
17. Kichatova V.S., Kyuregyan K.K. Sovremennyi vzglyad na rezistentnost' k preparatam pryamogo protivovirusnogo deistviya pri lechenii virusnogo gepatita S. Infektsionnye bolezni: novosti, mneniya, obuchenie. 2019; 8(2): 64–71. https://doi.org/10.24411/2305-3496-2019-12009
18. Feld J.J. Resistance testing: Interpretation and incorporation into HCV treatment algorithms. Clin. Liver Dis. (Hoboken). 2017; 9(5): 115–20. https://doi.org/10.1002/cld.631
19. Valutite D.E. Aprobatsiya molekulyarno-geneticheskogo metoda vyyavleniya mutatsii lekarstvennoi ustoichivosti virusa gepatita S. V kn.: Sbornik tezisov VIII mezhdunarodnogo molodezhnogo meditsinskogo kongressa «Sankt-Peterburgskie nauchnye chteniya». SPb.; 2019: 180.
20. Lawitz E., Mangia A., Wyles D., Rodriguez-Torres M., Hassanein T., Gordon S.C., et al. Sofosbuvir for previously untreated chronic hepatitis C infection. N. Engl. J. Med. 2013; 368(20): 1878–87. https://doi.org/10.1056/nejmoa1214853
21. European Association for the Study of the Liver. EASL recommendations on treatment of hepatitis C 2016. J. Hepatol. 2017; 66(1): 153–94. https://doi.org/10.1016/j.jhep.2016.09.001
22. Nitta S., Asahina Y., Matsuda M., Yamada N., Sugiyama R., Masaki T., et al. Effects of resistance-associated NS5A mutations in hepatitis C virus on viral production and susceptibility to antiviral reagents. Sci. Rep. 2016; 6: 34652. https://doi.org/10.1038/srep34652
23. Lemm J.A., O'Boyle D., Liu M., Nower P.T., Colonno R., Deshpande M.S., et al. Identification of hepatitis C virus NS5A inhibitors. J. Virol. 2010; 84(1): 482–91. https://doi.org/10.1128/jvi.01360-09
24. Charlton M., Gane E., Manns M.P., Brown R.S., Curry M.P., Kwo P.Y., et al. Sofosbuvir and ribavirin for treatment of compensated recurrent hepatitis C virus infection after liver transplantation. Gastroenterology. 2015; 148(1): 108–17. https://doi.org/10.1053/j.gastro.2014.10.001
25. Wang Y., Rao H.Y., Xie X.W., Wei L. Direct-acting antiviral agents resistance-associated polymorphisms in Shinese treatment-naïve patients infected with genotype 1b hepatitis C virus. Chin. Med. J. (Engl). 2015; 128(19): 2625–31. https://doi.org/10.4103/0366-6999.166038
26. Amer F., Yousif M.M., Hammad N.M., Garcia-Cehic D., Gregori J., Rando-Segura A., et al. Deep-sequencing study of HCV G4a resistance-associated substitutions in Egyptian patients failing DAA treatment. Infect. Drug Resist. 2019; 12: 2799–807. https://doi.org/10.2147/idr.s214735
27. Bellocchi M.C., Aragri M., Carioti L., Fabeni L., Pipitone R.M., Brancaccio G., et al. NS5A gene analysis by next generation sequencing in HCV nosocomial transmission clusters of HCV genotype 1b infected patients. Cells. 2019; 8(7): 666. https://doi.org/10.3390/cells8070666
28. Georg von Massow G., Garcia-Cehic D., Gregori J., Rodriguez-Frias F., Macià M.D., Escarda A., et al. Whole-genome characterization and resistance-associated substitutions in a new HCV genotype 1 subtype. Infect. Drug Resist. 2019; 12: 947–55. https://doi.org/10.2147/idr.s195441
29. Semenov A.V., Ostankova Yu.V., Gerasimova V.V., Bichurina M.A., Kozlov A.V., Mukomolov S.L. i dr. Molekulyarnoepidemiologicheskie osobennosti izolyatov virusa gepatita c iz raznykh regionov Respubliki Sakha (Yakutiya). Infektsiya i immunitet. 2015; 5(4): 359–72.
События
-
Журнал «Концепт: Философия, религия, культура» принят в Scopus >>>
9 июл 2025 | 13:25 -
К платформе Elpub присоединился журнал «The BRICS Health Journal» >>>
10 июн 2025 | 12:52 -
Журнал «Неотложная кардиология и кардиоваскулярные риски» присоединился к Elpub >>>
6 июн 2025 | 09:45 -
К платформе Elpub присоединился «Медицинский журнал» >>>
5 июн 2025 | 09:41 -
НЭИКОН принял участие в конференции НИИ Организации здравоохранения и медицинского менеджмента >>>
30 мая 2025 | 10:32