Журналов:     Статей:        

Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2020; 97: 150-158

Клещевой энцефалит в Дальневосточном очаговом регионе евразийского континента

Леонова Галина Николаевна

https://doi.org/10.36233/0372-9311-2020-97-2-150-158

Аннотация

Проведен анализ активности природных очагов клещевого энцефалита (КЭ) в Дальневосточном федеральном округе (Приморском и Хабаровском краях, Еврейской автономной и Амурской областях), представленного единым Сихотэ-Алиньским очаговым регионом. К нему примыкают эндемичные территории Китая, Кореи, Японии. В последнее десятилетие, по сравнению с 1990-ми гг., произошло снижение показателей инфицированности иксодовых клещей и заболеваемости КЭ. Часто показатели зараженности иксодовых клещей по данным иммуноферментного анализа, полимеразной цепной реакции и изоляции вируса КЭ (ВКЭ) не совпадали. Активная циркуляция ВКЭ с участием доминирующих и дополнительных видов иксодовых клещей и мышевидных грызунов стала известна с 1952 г. в Китае, с 1990-х гг. - в Японии и с 2011 г. - в Южной Корее. На всех территориях определена циркуляция штаммов ВКЭ дальневосточного субтипа. Исключение составили 7 изолятов, выделенные в Южной Корее, которые по молекулярно-генетической характеристике оказались штаммами европейского субтипа. В 2017 г. стало известно об изоляции двух новых штаммов ВКЭ из органов диких грызунов Marmota himalayana на территориях ранее неизвестных природных очагов на Тянь-Шане (Китай). Молекулярно-генетические отличия этих изолятов от штаммов ВКЭ трех субтипов позволили констатировать появление нового гималайского субтипа ВКЭ (Him-TBEV), который, по мнению авторов, был «скрыт» в течение сотен лет. Можно также сделать предположение о процессах видообразования новых субтипов ВКЭ. Наиболее полное представление о дальневосточной популяции ВКЭ получено в последнее десятилетие ХХ в., что явилось основой и толчком для изучения и сравнительного анализа многочисленных штаммов ВКЭ, выделенных на территории евразийского континента.
Список литературы

1. Зильбер Л.А. Весенний (весенне-летний) эпидемический клещевой энцефалит. Архив биологических наук. 1939; 56(2): 9-37.

2. Онищенко Г.Г., Федоров Ю.М., Пакскина Н.Д. Организация надзора за клещевым энцефалитом и меры по его профилактике в Российской Федерации. Вопросы вирусологии. 2007; 52(5): 8-10.

3. Злобин В.И., Рудаков Н.В., Малов И.В. Клещевые трансмиссивные инфекции. Новосибирск: Наука; 2015.

4. Кучерук В.В., Иванова Л.М., Неронов В.М. Клещевой энцефалит. География природноочаговых болезней человека в связи с задачами их профилактики. М.; 1969: 171-216.

5. Коренберг Э.И. Биохорологическая структура вида (на примере таежного клеща). М.: Наука; 1979.

6. Коренберг Э.И., Ковалевский Ю.В. Районирование ареала клещевого энцефалита. В кн.: Итоги науки и техники: Медицинская география. М.: ВИНИТИ; 1981. Том 11.

7. Sun R.X., Lai S.J., Yang Y., Li X.L., Liu K., Yao H.W., et al. Mapping the distribution of tick-borne encephalitis in mainland China. Ticks Tick Borne Dis. 2017; 8(4): 631-9. DOI: http://doi.org/10.1016/j.ttbdis.2017.04.009

8. Yun S.M., Kim S.Y., Ju Y.R., Han M.G., Jeong Y.E., Ryou J. First complete genomic characterization of two tick-borne encephalitis virus isolates obtained from wild rodents in South Korea. Virus Genes. 2011; 42(3): 307-16. DOI: http://doi.org/10.1007/s11262-011-0575-y

9. Takashima I., Morita K., Chiba M., Hayasaka D., Sato T., Takezawa C., et al. A case of tick-borne encephalitis in Japan and isolation of the virus. J. Clin. Microbiol. 1997; 35(8): 1943-7.

10. Чунихин С.П., Леонова Г.Н. Экология и географическое распространение арбовирусов. М.: Медицина; 1985.

11. Беликова Н.П. Иксодовые клещи. В кн.: Природноочаговые болезни в Приморском крае. Владивосток; 1975: 162-80.

12. Волков В.И. Медико-экологический атлас Хабаровского края и Еврейской автономной области. Хабаровск; 2005.

13. Meng F., Ding M., Tan Z., Zhao Z., Xu L., Wu J., et al. Virome analysis of tick-borne viruses in Heilongjiang Province, China. Ticks Tick Borne Dis. 2019; 10(2): 412-20. DOI: http://doi.org/10.1016/j.ttbdis.2018.12.002

14. Takeda T., Ito T., Chiba M., Takahashi K., Niioka T., Takashima I. Isolation of tick-borne encephalitis virus from Ixodes ovatus (Acari: Ixodidae) in Japan. J. Med. Entomol. 1998; 35(3): 227-31. DOI: http://doi.org/10.1093/jmedent/35.3.227

15. Takeda T., Ito T., Osada M., Takahashi K., Takashima I. Isolation of tick-borne encephalitis virus from wild rodents and a seroepizootiologic survey in Hokkaido, Japan. Am. J. Trop. Med. Hyg. 1999; 60(2): 287-91. DOI: http://doi.org/10.4269/ajtmh.1999.60.287

16. Якименко В.В., Дрокин Д.А., Калмин О.Б., Богданов И.И., Иванов Д.И. К вопросу о влиянии host-эффекта на штаммовую изменчивость вируса клещевого энцефалита. Вопросы вирусологии. 1996; 41(3): 112-7.

17. Шаповал А.Н. Клещевой энцефаломиелит. М.: Медицина; 1980.

18. Леонова Г.Н. О нозологической однородности и эволюции клещевого энцефалита. Тихоокеанский медицинский журнал. 2010; (3): 19-22.

19. Сомова Л.М., Леонова Г.Н. Патология центральной нервной системы при дальневосточном клещевом энцефалите. В кн.: Ишмухаметов А.А., ред. Патология нейроинфекций, вызываемых вирусами комплекса клещевого энцефалита. М.: Синтерия; 2018: 19-49. DOI: http://doi.org/10.26100/5DQY-TN22

20. Zhang D.H., Zhang Z.X., Wang Y.M. Study on the trend of the epidemic of tick-borne encephalitis in Heilongjiang province. Ji Bing Jian Ce. 2000; 15: 57-8. (in Chinese)

21. Lu Z., Bröker M., Liang G. Tick-Borne Encephalitis in Mainland China. Vector Borne Zoonotic Dis. 2008; 8(5): 713-20. DOI: http://doi.org/10.1089/vbz.2008.0028

22. Леонова Г.Н. Динамика эпидемической ситуации по клещевому энцефалиту на Дальнем Востоке. Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2015; 14(3): 17-22.

23. Мельникова О.В., Андаев Е.И. Связь манифестных случаев клещевого вирусного энцефалита с некоторыми демографическими, социальными и экологическими факторами. Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2014; (4): 37-45.

24. Мерзлова Н.Б., Серова И.А., Ягодина А.Ю. Классификации инфекционных и паразитарных болезней по социологическим критериям. Медицинская паразитология и паразитарные болезни. 2011; (2): 35-9.

25. Yoshii K., Song J.Y., Park S.B., Yang J., Schmitt H.J. Tick-borne encephalitis in Japan, Republic of Korea and China. Emerg. Microbes Infect. 2017; 6(9): e82. DOI: http://doi.org/10.1038/emi.2017.69

26. Леонова Г.Н., Беликов С.И., Кондратов И.Г. Современный взгляд на дальневосточную популяцию вируса клещевого энцефалита. Медицинская вирусология. 2017; 31(1): 32.

27. Захарычева Т.А. Клещевой энцефалит в Хабаровском крае: вчера, сегодня, завтра. Хабаровск; 2014.

28. Драгомерецкая А.Г., Мжельская Т.В., Ковальский А.Г., Высочина Н.П., Троценко О.Е., Каравянская Т.Н. и др. Результаты мониторинга за активностью природных очагов трансмиссивных инфекций на территории Хабаровского края в эпидемический сезон 2016 года. Дальневосточный журнал инфекционной патологии. 2017; (32): 45-51.

29. Pukhovskaya N.M., Morozova O.V., Vysochina N.P., Belozerova N.B., Bakhmetyeva S.V., Zdanovskaya N.I., et al. Tick-borne encephalitis virus in arthropod vectors in the Far East of Russia. Ticks Tick Borne Dis. 2018; 9(4): 824-33. DOI: http://doi.org/10.1016/j.ttbdis.2018.01.020

30. Шутикова А.Л., Леонова Г.Н., Лубова В.А. Молекулярно-генетический мониторинг как основа современного эпидемиологического надзора за клещевыми инфекциями. Клиническая лабораторная диагностика. 2019; 64(7): 424-9. DOI: http://doi.org/10.18821/0869-2084-2019-64-7-424-429

31. Леонова Г.Н., Лубова В.А., Иванис В.А. Мониторинг возбудителей клещевых инфекций на территории Приморского края в период 2014–2018 гг. Тихоокеанский медицинский журнал. 2018; (4): 10-4.

32. Лубова В.А., Леонова Г.Н., Бондаренко Е.И. Комплексная характеристика природных очагов клещевых инфекций на юго-восточных территориях Сихотэ-Алиня. Здоровье. Медицинская экология. Наука. 2017; (1): 30-5. DOI: http://doi.org/10.5281/zenodo.345611

33. Мельникова О.В., Адельшин Р.В., Корзун В.М., Трушина Ю.Н., Андаев Е.И. Характеристика изолятов вируса клещевого энцефалита из природных очагов в Иркутской области и уточнение генотипического пейзажа. Вопросы вирусологии. 2016; 61(5): 229-34. DOI: http://doi.org/10.18821/0507-4088-2016-61-5-229-234

34. Леонова Г.Н. Сравнительный анализ эффективности методов верификации вируса клещевого энцефалита. Клиническая лабораторная диагностика. 2019; 64(11): 686-9. DOI: http://doi.org/10.18821/0869-2084-2019-64-11-686-689

35. Ефимова А.Р., Карань Л.С., Дроздова О.М., Григорьева А.Я., Фролова Н.А., Шейдерова И.Д. и др. Современная эпидемиологическая ситуация по клещевому энцефалиту и генетическое разнообразие ВКЭ на территории Кемеровской области. Труды Института полиомиелита и вирусных энцефалитов имени М.П. Чумакова РАМН. Медицинская вирусология. 2015; 29(1): 3-15.

36. Иванов М.К., Прасолова М.А., Тимофеев Д.И., Глушков С.А., Кандрушин Е.В. Одновременное выявление двух мишеней – подход к решению проблем ПЦР-диагностики заболеваний, вызываемых вирусами с высокой генетической изменчивостью. В кн.: Материалы научно-практической конференции «Диагностика и профилактика инфекционных болезней на современном этапе». Новосибирск; 2016: 156-7.

37. Коренберг Э.И. Молекулярно-биологические методы и изучение феномена природной очаговости болезней. Успехи современной биологии. 2012; 132(5): 448-62.

38. Ternovoi V.A., Protopopova E.V., Chausov E.V., Novikov D.V., Leonova G.N., Netesov SV., et al. Novel variant of tickborne encephalitis virus, Russia. Emerg. Infect. Dis. 2007; 13(10): 1574-8. DOI: http://doi.org/10.3201/eid1310.070158

39. Si B.Y., Jiang T., Zhang Y., Deng Y.Q., Huo Q.B., Zheng Y.C., et al. Complete genome sequence analysis of tick-borne encephalitis viruses isolated in northeastern China. Arch. Virol. 2011; 156(8): 1485-8. DOI: http://doi.org/10.1007/s00705-011-1031-y

40. Zhang Y., Si B.Y., Liu B.H., Chang G.H., Yang Y.H., Huo Q.B., et al. Complete genomic characterization of two tick-borne encephalitis viruses isolated from China. Virus Res. 2012; 167(2): 310-31. DOI: http://doi.org/10.1016/j.virusres.2012.05.015

41. Hayasaka D., Suzuki Y., Kariwa H., Ivanov L., Volkov V., Demenev V., et al. Phylogenetic and virulence analysis of tickborne encephalitis viruses from Japan and far-eastern Russia. J. Gen. Virology. 1999; 80(Pt. 12): 3127-35. DOI: http://doi.org/10.1099/0022-1317-80-12-3127

42. Leonova G.N., Belikov S.I., Kondratov I.G., Takashima I. Comprehensive assessment of the genetics and virulence of tick-borne encephalitis virus strains isolated from patients with inapparent and clinical forms of the infection in the Russian Far East. Virology. 2013; 443(1): 89-98. DOI: http://doi.org/10.1016/j.virol.2013.04.029

43. Leonova G.N., Maystrovskaya O.S., Kondratov I.G., Takashima I., Belikov S.I. The nature of replication of tick-borne encephalitis virus strains isolated from residents of the Russian Far East with inapparent and clinical forms of infection. Virus Res. 2014; 189: 34-42. DOI: http://doi.org/10.1016/j.virusres.2014.04.004

44. Belikov S.I., Kondratov I.G., Potapova U.V., Leonova G.N. The relationship between the structure of the tick-borne encephalitis virus strains and their pathogenic properties. PLoS One. 2014; 9(4): e94946. DOI: http://doi.org/10.1371/journal.pone.0094946

45. Leonova G.N., Belikov S.I., Kondratov I.G. Characteristics of far eastern strains of tick-borne encephalitis virus. Arch. Virol. 2017; 162(8): 2211-8. DOI: http://doi.org/10.1007/s00705-017-3309-1

46. Pletnev A.G., Yamshchikov V.F., Blinov V.M. Nucleotide sequence of the genome and complete amino acid sequence of the polyprotein of tick-borne encephalitis virus. Virology. 1990; 174(1): 250-63. DOI: http://doi.org/10.1016/0042-6822(90)90073-z

47. Bertrand Y., Töpel M., Elväng A., Melik W., Johansson M. First dating of a recombination event in mammalian tick-borne flaviviruses. PLoS One. 2012; 7(2): e31981. DOI: http://doi.org/10.1371/journal.pone.0031981

48. Norbergn P., Roth A., Bergström T. Genetic recombination of tick-borne flaviviruses among wild-type strains. Virology. 2013; 440(2): 105-16. DOI: http://doi.org/10.1016/j.virol.2013.02.017

49. Bertrand Y., Johansson M., Norberg P. Revisiting recombination signal in the tick-borne encephalitis virus: a simulation approach. PLoS One. 2016; 11(10): e0164435. DOI: http://doi.org/10.1371/journal.pone.0164435

50. Vorovitch M.F., Kozlovskaya L.I., Romanova L.Iu., Chernokhaeva L.L., Ishmukhametov A.A., Karganova G.G. Genetic description of a tick-borne encephalitis virus strain Sofjin with the longest history as a vaccine strain. Springerplus. 2015; 4: 761. DOI: http://doi.org/10.1186/s40064-015-1561-y

Journal of microbiology, epidemiology and immunobiology. 2020; 97: 150-158

Tick-borne encephalitis in the Far East focal region of the Eurasian continent

Leonova Galina N.

https://doi.org/10.36233/0372-9311-2020-97-2-150-158

Abstract

The analysis of the activity of natural foci of tick-borne encephalitis (TBE) in the Far Eastern Federal District (Primorsky and Khabarovsk Territories, the Jewish Autonomous and Amur Regions), represented by a single Sikhote-Alin focal region was performed. Endemic territories of China, Korea, Japan are adjacent to this focal region. In the last decade the decrease of the infection rate in ixodid ticks and the morbidity of TBE compared to the 1990s was observed. Data on the infection rates in ixodid ticks based on ELISA, PCR and TBEV isolation are often discrepant. Active circulation of TBEV that involved dominant and less significant species of ixodid ticks and mouse-like rodents has been demonstrated since 1952 in China, since the 1990s in Japan and since 2011 in South Korea. The circulation of TBEV strains of the Far Eastern subtype was determined in all these territories. The exception was 7 strains isolated in South Korea, which appeared to be the European subtype based on the results of molecular genetic analysis. Two new strains of TBEV from the organs of wild rodents Marmota himalayana were isolated in 2017 in the territories of previously unknown natural foci in the Tien Shan, China. The genetic divergence of these strains from three TBEV subtypes allowed us to establish the existance of a new Himalayan TBEV subtype (Him-TBEV), which, according to the authors, has been "hidden" for hundreds of years. One can also speculate the processes of emergence of new TBEV subtypes The most complete picture of the Far Eastern population of TBEV was obtained in the last decade of the twentieth century, which served as the basis and impetus for the study and comparative analysis of the differences in numerous strains of TBEV isolated on the territory of the Eurasian continent.
References

1. Zil'ber L.A. Vesennii (vesenne-letnii) epidemicheskii kleshchevoi entsefalit. Arkhiv biologicheskikh nauk. 1939; 56(2): 9-37.

2. Onishchenko G.G., Fedorov Yu.M., Pakskina N.D. Organizatsiya nadzora za kleshchevym entsefalitom i mery po ego profilaktike v Rossiiskoi Federatsii. Voprosy virusologii. 2007; 52(5): 8-10.

3. Zlobin V.I., Rudakov N.V., Malov I.V. Kleshchevye transmissivnye infektsii. Novosibirsk: Nauka; 2015.

4. Kucheruk V.V., Ivanova L.M., Neronov V.M. Kleshchevoi entsefalit. Geografiya prirodnoochagovykh boleznei cheloveka v svyazi s zadachami ikh profilaktiki. M.; 1969: 171-216.

5. Korenberg E.I. Biokhorologicheskaya struktura vida (na primere taezhnogo kleshcha). M.: Nauka; 1979.

6. Korenberg E.I., Kovalevskii Yu.V. Raionirovanie areala kleshchevogo entsefalita. V kn.: Itogi nauki i tekhniki: Meditsinskaya geografiya. M.: VINITI; 1981. Tom 11.

7. Sun R.X., Lai S.J., Yang Y., Li X.L., Liu K., Yao H.W., et al. Mapping the distribution of tick-borne encephalitis in mainland China. Ticks Tick Borne Dis. 2017; 8(4): 631-9. DOI: http://doi.org/10.1016/j.ttbdis.2017.04.009

8. Yun S.M., Kim S.Y., Ju Y.R., Han M.G., Jeong Y.E., Ryou J. First complete genomic characterization of two tick-borne encephalitis virus isolates obtained from wild rodents in South Korea. Virus Genes. 2011; 42(3): 307-16. DOI: http://doi.org/10.1007/s11262-011-0575-y

9. Takashima I., Morita K., Chiba M., Hayasaka D., Sato T., Takezawa C., et al. A case of tick-borne encephalitis in Japan and isolation of the virus. J. Clin. Microbiol. 1997; 35(8): 1943-7.

10. Chunikhin S.P., Leonova G.N. Ekologiya i geograficheskoe rasprostranenie arbovirusov. M.: Meditsina; 1985.

11. Belikova N.P. Iksodovye kleshchi. V kn.: Prirodnoochagovye bolezni v Primorskom krae. Vladivostok; 1975: 162-80.

12. Volkov V.I. Mediko-ekologicheskii atlas Khabarovskogo kraya i Evreiskoi avtonomnoi oblasti. Khabarovsk; 2005.

13. Meng F., Ding M., Tan Z., Zhao Z., Xu L., Wu J., et al. Virome analysis of tick-borne viruses in Heilongjiang Province, China. Ticks Tick Borne Dis. 2019; 10(2): 412-20. DOI: http://doi.org/10.1016/j.ttbdis.2018.12.002

14. Takeda T., Ito T., Chiba M., Takahashi K., Niioka T., Takashima I. Isolation of tick-borne encephalitis virus from Ixodes ovatus (Acari: Ixodidae) in Japan. J. Med. Entomol. 1998; 35(3): 227-31. DOI: http://doi.org/10.1093/jmedent/35.3.227

15. Takeda T., Ito T., Osada M., Takahashi K., Takashima I. Isolation of tick-borne encephalitis virus from wild rodents and a seroepizootiologic survey in Hokkaido, Japan. Am. J. Trop. Med. Hyg. 1999; 60(2): 287-91. DOI: http://doi.org/10.4269/ajtmh.1999.60.287

16. Yakimenko V.V., Drokin D.A., Kalmin O.B., Bogdanov I.I., Ivanov D.I. K voprosu o vliyanii host-effekta na shtammovuyu izmenchivost' virusa kleshchevogo entsefalita. Voprosy virusologii. 1996; 41(3): 112-7.

17. Shapoval A.N. Kleshchevoi entsefalomielit. M.: Meditsina; 1980.

18. Leonova G.N. O nozologicheskoi odnorodnosti i evolyutsii kleshchevogo entsefalita. Tikhookeanskii meditsinskii zhurnal. 2010; (3): 19-22.

19. Somova L.M., Leonova G.N. Patologiya tsentral'noi nervnoi sistemy pri dal'nevostochnom kleshchevom entsefalite. V kn.: Ishmukhametov A.A., red. Patologiya neiroinfektsii, vyzyvaemykh virusami kompleksa kleshchevogo entsefalita. M.: Sinteriya; 2018: 19-49. DOI: http://doi.org/10.26100/5DQY-TN22

20. Zhang D.H., Zhang Z.X., Wang Y.M. Study on the trend of the epidemic of tick-borne encephalitis in Heilongjiang province. Ji Bing Jian Ce. 2000; 15: 57-8. (in Chinese)

21. Lu Z., Bröker M., Liang G. Tick-Borne Encephalitis in Mainland China. Vector Borne Zoonotic Dis. 2008; 8(5): 713-20. DOI: http://doi.org/10.1089/vbz.2008.0028

22. Leonova G.N. Dinamika epidemicheskoi situatsii po kleshchevomu entsefalitu na Dal'nem Vostoke. Epidemiologiya i vaktsinoprofilaktika. 2015; 14(3): 17-22.

23. Mel'nikova O.V., Andaev E.I. Svyaz' manifestnykh sluchaev kleshchevogo virusnogo entsefalita s nekotorymi demograficheskimi, sotsial'nymi i ekologicheskimi faktorami. Epidemiologiya i vaktsinoprofilaktika. 2014; (4): 37-45.

24. Merzlova N.B., Serova I.A., Yagodina A.Yu. Klassifikatsii infektsionnykh i parazitarnykh boleznei po sotsiologicheskim kriteriyam. Meditsinskaya parazitologiya i parazitarnye bolezni. 2011; (2): 35-9.

25. Yoshii K., Song J.Y., Park S.B., Yang J., Schmitt H.J. Tick-borne encephalitis in Japan, Republic of Korea and China. Emerg. Microbes Infect. 2017; 6(9): e82. DOI: http://doi.org/10.1038/emi.2017.69

26. Leonova G.N., Belikov S.I., Kondratov I.G. Sovremennyi vzglyad na dal'nevostochnuyu populyatsiyu virusa kleshchevogo entsefalita. Meditsinskaya virusologiya. 2017; 31(1): 32.

27. Zakharycheva T.A. Kleshchevoi entsefalit v Khabarovskom krae: vchera, segodnya, zavtra. Khabarovsk; 2014.

28. Dragomeretskaya A.G., Mzhel'skaya T.V., Koval'skii A.G., Vysochina N.P., Trotsenko O.E., Karavyanskaya T.N. i dr. Rezul'taty monitoringa za aktivnost'yu prirodnykh ochagov transmissivnykh infektsii na territorii Khabarovskogo kraya v epidemicheskii sezon 2016 goda. Dal'nevostochnyi zhurnal infektsionnoi patologii. 2017; (32): 45-51.

29. Pukhovskaya N.M., Morozova O.V., Vysochina N.P., Belozerova N.B., Bakhmetyeva S.V., Zdanovskaya N.I., et al. Tick-borne encephalitis virus in arthropod vectors in the Far East of Russia. Ticks Tick Borne Dis. 2018; 9(4): 824-33. DOI: http://doi.org/10.1016/j.ttbdis.2018.01.020

30. Shutikova A.L., Leonova G.N., Lubova V.A. Molekulyarno-geneticheskii monitoring kak osnova sovremennogo epidemiologicheskogo nadzora za kleshchevymi infektsiyami. Klinicheskaya laboratornaya diagnostika. 2019; 64(7): 424-9. DOI: http://doi.org/10.18821/0869-2084-2019-64-7-424-429

31. Leonova G.N., Lubova V.A., Ivanis V.A. Monitoring vozbuditelei kleshchevykh infektsii na territorii Primorskogo kraya v period 2014–2018 gg. Tikhookeanskii meditsinskii zhurnal. 2018; (4): 10-4.

32. Lubova V.A., Leonova G.N., Bondarenko E.I. Kompleksnaya kharakteristika prirodnykh ochagov kleshchevykh infektsii na yugo-vostochnykh territoriyakh Sikhote-Alinya. Zdorov'e. Meditsinskaya ekologiya. Nauka. 2017; (1): 30-5. DOI: http://doi.org/10.5281/zenodo.345611

33. Mel'nikova O.V., Adel'shin R.V., Korzun V.M., Trushina Yu.N., Andaev E.I. Kharakteristika izolyatov virusa kleshchevogo entsefalita iz prirodnykh ochagov v Irkutskoi oblasti i utochnenie genotipicheskogo peizazha. Voprosy virusologii. 2016; 61(5): 229-34. DOI: http://doi.org/10.18821/0507-4088-2016-61-5-229-234

34. Leonova G.N. Sravnitel'nyi analiz effektivnosti metodov verifikatsii virusa kleshchevogo entsefalita. Klinicheskaya laboratornaya diagnostika. 2019; 64(11): 686-9. DOI: http://doi.org/10.18821/0869-2084-2019-64-11-686-689

35. Efimova A.R., Karan' L.S., Drozdova O.M., Grigor'eva A.Ya., Frolova N.A., Sheiderova I.D. i dr. Sovremennaya epidemiologicheskaya situatsiya po kleshchevomu entsefalitu i geneticheskoe raznoobrazie VKE na territorii Kemerovskoi oblasti. Trudy Instituta poliomielita i virusnykh entsefalitov imeni M.P. Chumakova RAMN. Meditsinskaya virusologiya. 2015; 29(1): 3-15.

36. Ivanov M.K., Prasolova M.A., Timofeev D.I., Glushkov S.A., Kandrushin E.V. Odnovremennoe vyyavlenie dvukh mishenei – podkhod k resheniyu problem PTsR-diagnostiki zabolevanii, vyzyvaemykh virusami s vysokoi geneticheskoi izmenchivost'yu. V kn.: Materialy nauchno-prakticheskoi konferentsii «Diagnostika i profilaktika infektsionnykh boleznei na sovremennom etape». Novosibirsk; 2016: 156-7.

37. Korenberg E.I. Molekulyarno-biologicheskie metody i izuchenie fenomena prirodnoi ochagovosti boleznei. Uspekhi sovremennoi biologii. 2012; 132(5): 448-62.

38. Ternovoi V.A., Protopopova E.V., Chausov E.V., Novikov D.V., Leonova G.N., Netesov SV., et al. Novel variant of tickborne encephalitis virus, Russia. Emerg. Infect. Dis. 2007; 13(10): 1574-8. DOI: http://doi.org/10.3201/eid1310.070158

39. Si B.Y., Jiang T., Zhang Y., Deng Y.Q., Huo Q.B., Zheng Y.C., et al. Complete genome sequence analysis of tick-borne encephalitis viruses isolated in northeastern China. Arch. Virol. 2011; 156(8): 1485-8. DOI: http://doi.org/10.1007/s00705-011-1031-y

40. Zhang Y., Si B.Y., Liu B.H., Chang G.H., Yang Y.H., Huo Q.B., et al. Complete genomic characterization of two tick-borne encephalitis viruses isolated from China. Virus Res. 2012; 167(2): 310-31. DOI: http://doi.org/10.1016/j.virusres.2012.05.015

41. Hayasaka D., Suzuki Y., Kariwa H., Ivanov L., Volkov V., Demenev V., et al. Phylogenetic and virulence analysis of tickborne encephalitis viruses from Japan and far-eastern Russia. J. Gen. Virology. 1999; 80(Pt. 12): 3127-35. DOI: http://doi.org/10.1099/0022-1317-80-12-3127

42. Leonova G.N., Belikov S.I., Kondratov I.G., Takashima I. Comprehensive assessment of the genetics and virulence of tick-borne encephalitis virus strains isolated from patients with inapparent and clinical forms of the infection in the Russian Far East. Virology. 2013; 443(1): 89-98. DOI: http://doi.org/10.1016/j.virol.2013.04.029

43. Leonova G.N., Maystrovskaya O.S., Kondratov I.G., Takashima I., Belikov S.I. The nature of replication of tick-borne encephalitis virus strains isolated from residents of the Russian Far East with inapparent and clinical forms of infection. Virus Res. 2014; 189: 34-42. DOI: http://doi.org/10.1016/j.virusres.2014.04.004

44. Belikov S.I., Kondratov I.G., Potapova U.V., Leonova G.N. The relationship between the structure of the tick-borne encephalitis virus strains and their pathogenic properties. PLoS One. 2014; 9(4): e94946. DOI: http://doi.org/10.1371/journal.pone.0094946

45. Leonova G.N., Belikov S.I., Kondratov I.G. Characteristics of far eastern strains of tick-borne encephalitis virus. Arch. Virol. 2017; 162(8): 2211-8. DOI: http://doi.org/10.1007/s00705-017-3309-1

46. Pletnev A.G., Yamshchikov V.F., Blinov V.M. Nucleotide sequence of the genome and complete amino acid sequence of the polyprotein of tick-borne encephalitis virus. Virology. 1990; 174(1): 250-63. DOI: http://doi.org/10.1016/0042-6822(90)90073-z

47. Bertrand Y., Töpel M., Elväng A., Melik W., Johansson M. First dating of a recombination event in mammalian tick-borne flaviviruses. PLoS One. 2012; 7(2): e31981. DOI: http://doi.org/10.1371/journal.pone.0031981

48. Norbergn P., Roth A., Bergström T. Genetic recombination of tick-borne flaviviruses among wild-type strains. Virology. 2013; 440(2): 105-16. DOI: http://doi.org/10.1016/j.virol.2013.02.017

49. Bertrand Y., Johansson M., Norberg P. Revisiting recombination signal in the tick-borne encephalitis virus: a simulation approach. PLoS One. 2016; 11(10): e0164435. DOI: http://doi.org/10.1371/journal.pone.0164435

50. Vorovitch M.F., Kozlovskaya L.I., Romanova L.Iu., Chernokhaeva L.L., Ishmukhametov A.A., Karganova G.G. Genetic description of a tick-borne encephalitis virus strain Sofjin with the longest history as a vaccine strain. Springerplus. 2015; 4: 761. DOI: http://doi.org/10.1186/s40064-015-1561-y