Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2018; 1: 40-44
ОСОБЕННОСТИ РЕКОМБИНАЦИОННОЙ ГЕНОМИКИ БАКТЕРИЙ РОДА ACINETOBACTER — ПАТОГЕНОВ ЧЕЛОВЕКА
https://doi.org/10.36233/0372-9311-2018-3-40-44Аннотация
Цель. Определение роли изменчивости генетических маркеров в формировании лекарственно-устойчивого фенотипа представителей рода Acinetobacter. Материалы и методы. Проведен сравнительный анализ изменчивости важного для генетической рекомбинации фрагмента ДНК у A.baumannii — одного из наиболее актуальных возбудителей послеоперационных инфекций, а также A. pittii и A. lwoffii. Результаты. Показано, что последовательность изученного участка хромосомы с геном интегразы/рекомбиназы XerC весьма изменчива, в частности, здесь могут быть представлены гены, ответственные за развитие резистентности к полимиксинам и (фтор)хинолонам, а также другим антибиотикам. Заключение. Полученные результаты важны для контроля за эпидемическими (пандемическими) штаммами ацинетобактера.
Список литературы
1. Гончаров А.Е., Еремеева М.И., Зубарева Н.А., Соломенный А.П. Генотипический анализ карбапенем-устойчивого штамма Acinetobacter baumannii. Перм. мед. журнал. 2011, 28 (6): 95-99.
2. Сухорукова М.В., Эйдельштейн М.В., Склеенова Е.Ю., Иванчик Н.В., Тимохова А.В., Шек Е.А., Дехнич А.В., Козлов Р.С. и исследовательская группа «Марафон». Антибиотикорезистентность нозокомиальных штаммов Acinetobacter spp. в стационарах России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования МАРАФОН в 2011—2012 гг. Клин. микробиол. антимикроб. химиотер. 2014, 16 (4): 266-272.
3. Сухорукова М.В., Эйдельштейн М.В., Склеенова Е.Ю., Иванчик Н.В., Шек Е.А., Дехнич А.В., Козлов Р.С. и исследовательская группа «Марафон» Антибиотикорезистентность нозокомиальных штаммов Acinetobacter spp. в стационарах России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования «Марафон» 2013—2014. Клин. микробиол. антимикроб. химиотер. 2017, 19 (1): 42-48.
4. Чеботарь И.В., Лазарева А.В., Масалов Я.К., Михайлович В.М., Маянский Н.А. Acinetobacter: микробиологические, патогенетические и резистентные свойства. Вестник РАМН. 2014, 9-10: 39-50.
5. Antunes L.C., Visca P., Towner K.J. Acinetobacter baumannii: evolution of a global pathogen. Pathog. Dis. 2014, 71: 292-301.
6. Castillo F., Benmohamed A., Szatmari G. Xer site specific recombination: double and single recombinase systems. Front. Microbiol. 2017, 8: Art. 453.
7. Dettori M., Piana A., Deriu M.G. et al. Outbreak of multidrug-resistant Acinetobacter baumannii in an intensive care unit. New Microbiol. 2014, 37: 185-191.
8. Ellington M.J., Ekelund O., Aarestrup F.M. et al. The role of whole genome sequencing in antimicrobial susceptibility testing of bacteria: report from the EUCAST Subcommittee. Clin. Microbiol. Infect. 2017, 23: 2-22.
9. Harding C.M., Hennon S.W., Feldman M.F. Uncovering the mechanisms of Acinetobacter baumannii virulence. Nat. Rev. Microbiol. 2018. 16: 91-102.
10. Krzyciak P., Chmielarczyk A., Pobiega M. et al. Acinetobacter baumannii isolated from hospital-acquired infection: biofilm production and drug susceptibility. APMIS. 2017, 125: 1017-1026.
11. Olaitan A.O., Morand S., Rolain J-M. Mechanisms of polymyxin resistance: acquired and intrinsic resistance in bacteria. Front. Microbiol. 2014, 5: Art. 643.
12. Oikonomou O., Sarrou S., Papagiannitsis C.C. et al. Rapid dissemination of colistin and carbapenem resistant Acinetobacter baumannii in Central Greece: mechanisms of resistance, molecular identification and epidemiological data. BMC Infect. Dis. 2015, 15: Art. 559.
13. Segagni Lusignani L., Starzengruber P., Dosch V. et al. Molecular epidemiology of multidrugresistant clinical isolates of Acinetobacter baumannii: A 10-year analysis in a large tertiary care university hospital in central Europe with international admissions. Wien Klin. Wochenschr. 2017, 129: 816-822.
14. Shafaati M., Boroumand M., Nowroozi J. et al. Correlation between qacE and qacEΔ1 efflux pump genes, antibiotic and disinfectant resistant among clinical isolates of E. coli. Recent Pat. Antiinfect. Drug Discov. 2016, 11: 189-195.
15. Wilharm G., Skiebe E., Higgins P.G. et al. Relatedness of wildlife and livestock avian isolates of the nosocomial pathogen Acinetobacter baumannii to lineages spread in hospitals worldwide. Environ. Microbiol. 2017, 19: 4349-4364.
Journal of microbiology, epidemiology and immunobiology. 2018; 1: 40-44
PECULIARITIES OF RECOMBINATIVE GENOMICS OF ACINETOBACTER — HUMAN PATHOGEN
https://doi.org/10.36233/0372-9311-2018-3-40-44Abstract
Aim. The disclosure of the role of genetic markers variability among Acinetobacter genus in connection with multidrug-resistant phenotype realization. Materials and methods. A comparative analysis was reviewed on DNA fragments important for genetic recombination in A. baumannii — one of the most relevant pathogens of postoperative infection, as well as A. pittii and A. lwoffii. Results. Integrase/recombinase XerC gene-bearing region of the chromosome is notably different and could include the genes responsible for the development of resistance against polymyxins and (fluoro)quinolones, as well as other antibiotics. Conclusion. The results obtained are important in surveillance of epidemic (pandemic) strains of Acinetobacter spp.
References
1. Goncharov A.E., Eremeeva M.I., Zubareva N.A., Solomennyi A.P. Genotipicheskii analiz karbapenem-ustoichivogo shtamma Acinetobacter baumannii. Perm. med. zhurnal. 2011, 28 (6): 95-99.
2. Sukhorukova M.V., Eidel'shtein M.V., Skleenova E.Yu., Ivanchik N.V., Timokhova A.V., Shek E.A., Dekhnich A.V., Kozlov R.S. i issledovatel'skaya gruppa «Marafon». Antibiotikorezistentnost' nozokomial'nykh shtammov Acinetobacter spp. v statsionarakh Rossii: rezul'taty mnogotsentrovogo epidemiologicheskogo issledovaniya MARAFON v 2011—2012 gg. Klin. mikrobiol. antimikrob. khimioter. 2014, 16 (4): 266-272.
3. Sukhorukova M.V., Eidel'shtein M.V., Skleenova E.Yu., Ivanchik N.V., Shek E.A., Dekhnich A.V., Kozlov R.S. i issledovatel'skaya gruppa «Marafon» Antibiotikorezistentnost' nozokomial'nykh shtammov Acinetobacter spp. v statsionarakh Rossii: rezul'taty mnogotsentrovogo epidemiologicheskogo issledovaniya «Marafon» 2013—2014. Klin. mikrobiol. antimikrob. khimioter. 2017, 19 (1): 42-48.
4. Chebotar' I.V., Lazareva A.V., Masalov Ya.K., Mikhailovich V.M., Mayanskii N.A. Acinetobacter: mikrobiologicheskie, patogeneticheskie i rezistentnye svoistva. Vestnik RAMN. 2014, 9-10: 39-50.
5. Antunes L.C., Visca P., Towner K.J. Acinetobacter baumannii: evolution of a global pathogen. Pathog. Dis. 2014, 71: 292-301.
6. Castillo F., Benmohamed A., Szatmari G. Xer site specific recombination: double and single recombinase systems. Front. Microbiol. 2017, 8: Art. 453.
7. Dettori M., Piana A., Deriu M.G. et al. Outbreak of multidrug-resistant Acinetobacter baumannii in an intensive care unit. New Microbiol. 2014, 37: 185-191.
8. Ellington M.J., Ekelund O., Aarestrup F.M. et al. The role of whole genome sequencing in antimicrobial susceptibility testing of bacteria: report from the EUCAST Subcommittee. Clin. Microbiol. Infect. 2017, 23: 2-22.
9. Harding C.M., Hennon S.W., Feldman M.F. Uncovering the mechanisms of Acinetobacter baumannii virulence. Nat. Rev. Microbiol. 2018. 16: 91-102.
10. Krzyciak P., Chmielarczyk A., Pobiega M. et al. Acinetobacter baumannii isolated from hospital-acquired infection: biofilm production and drug susceptibility. APMIS. 2017, 125: 1017-1026.
11. Olaitan A.O., Morand S., Rolain J-M. Mechanisms of polymyxin resistance: acquired and intrinsic resistance in bacteria. Front. Microbiol. 2014, 5: Art. 643.
12. Oikonomou O., Sarrou S., Papagiannitsis C.C. et al. Rapid dissemination of colistin and carbapenem resistant Acinetobacter baumannii in Central Greece: mechanisms of resistance, molecular identification and epidemiological data. BMC Infect. Dis. 2015, 15: Art. 559.
13. Segagni Lusignani L., Starzengruber P., Dosch V. et al. Molecular epidemiology of multidrugresistant clinical isolates of Acinetobacter baumannii: A 10-year analysis in a large tertiary care university hospital in central Europe with international admissions. Wien Klin. Wochenschr. 2017, 129: 816-822.
14. Shafaati M., Boroumand M., Nowroozi J. et al. Correlation between qacE and qacEΔ1 efflux pump genes, antibiotic and disinfectant resistant among clinical isolates of E. coli. Recent Pat. Antiinfect. Drug Discov. 2016, 11: 189-195.
15. Wilharm G., Skiebe E., Higgins P.G. et al. Relatedness of wildlife and livestock avian isolates of the nosocomial pathogen Acinetobacter baumannii to lineages spread in hospitals worldwide. Environ. Microbiol. 2017, 19: 4349-4364.
