Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2019; : 30-36
Эпидемиологический и молекулярно-генетический мониторинг ротавирусной инфекции в Оренбургском регионе в предвакцинальный период
https://doi.org/10.36233/0372-9311-2019-2-30-36Аннотация
Цель. Провести анализ эпидемиологической ситуации по ротавирусной инфекции в Оренбургской области с учетом проявлений эпидемического процесса и молекулярно-генетических характеристик ротавирусов группы А. Материалы и методы. Представлены результаты эпидемиологического и молекулярно генетического мониторинга ротавирусной инфекции в период 2013-2017гг. Молекулярно-генетическое типирование проведено на 232 образцах фекалий пациентов возраста до 3 лет с клиникой РВИ. Использовались методы ретроспективного эпидемиологического анализа, ИФА, ПЦР. Результаты. Показатели заболеваемости РВИ — высокие и имели тенденцию к росту. Наиболее поражаемым контингентом были дети возраста до 14 лет. Генетический потенциал популяции ротавирусов в регионе представлен десятью основными генотипами. Ведущее значение в эпидемическом процессе имели генотипы с наиболее высокой частотой встречаемости: G4[P]8 (56,9%), G9[P]8 (12,9%), Mixt (8,6%), G2[P]4 (7,7%), G1[P]8 (6,5%). Заключение. Выявлен значительный рост заболеваемости РВИ среди детского населения. Определены доминирующие генотипы ротавирусов, показано их региональное многообразие и смена в течение нескольких сезонов.
Список литературы
1. Духовлинов И.В., Богомолова Е.Г., Федорова Е.А., Симбирцев А.С. Генетические и антигенные варианты ротавируса человека, циркулирующие на Европейской территории России. Инфекция и иммунитет.2014, 4(3):229-234.
2. Жираковская, Е.В., Аксанова Р.Х, Горбунова М.Г. и др. Генетическое разнообразие изолятов ротавирусов группы А, выявленных в Западной Сибири в 2007-2011 гг. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология.2012, 4:33-41.
3. Зайцева Е.В., Ольнева Т.А., Кулешов К.В., Подколзин А.Т., Шипулин Г.А. и др. Результаты мониторинга антигенных типов ротавирусов гр.А на территории Российской Федерации в период 2011-2015 гг. Клиническая лабораторная диагностика. 2016, 61(7) 445-448.
4. Кригер Е.А., Самодова О.В., Назаренко С.Ю. Внутрибольничная ротавирусная инфекция у детей. Инфекционные болезни. 2013, 11(3):62-65.
5. Литвинчук О.А., Коновалова Т.А., Подколзин А.Т., Горелов А.В., Шипулин Г.А. Нозокомиальные кишечные инфекции в инфекционных отделениях детских стационаров. Молекулярная диагностика. 2014, 2(12):413-415.
6. Плоскирева А.А. Острые кишечные инфекции вирусной этиологии у детей: клиника, диагностика и терапия. Автореферат дисс. докт. мед. наук. М, 2016.
7. Подколзин А.Т. Эпидемиологическая и клиническая характеристика острых кишечных инфекций вирусной этиологии в Российской Федерации. Автореф. дисс. докт. мед. наук. М., 2015.
8. Lanata C.F. Child Health Epidemiology Reference Group of the World Health Organization and UNICEF Global causes of diarrheal disease mortality in children younger 5 years of age: a systematic review. PLoS One. 2013, 8(9): e72788.
9. Lozano R., Naghavi M., Foreman K. Global and regional mortality from 235 causes of death for 20 age groups in 1990 and 2010: a systematic analysis for the Global Burden of Disease Study 2010. Lancet.2013;380(9859):2095-2128.
10. Мandal S., Mandal M.D. Is Rotavirus Gastroenteritis a Global Emerging. Re-Emerg Probl. Transl. Med. 2014, 4(143):2161-1025.
11. Parashar U.D., Gibson C.J., Bresee J.S. et al. Rotavirus and severe childhood diarrhea. Emerg.Infect. Dis. 2006, 12:304-306.
12. Vesicari T., Hemming M., Huhti L. et al. Rotavirus antigenemia in children is associated with more severe clinical manifestations of acute gastroenteritis. Pediatr. Infect. Dis. J. 2014, 33(4):366-371.
Journal of microbiology, epidemiology and immunobiology. 2019; : 30-36
Epidemiological and molecular-genetic monitoring of rotavirus infection in the Orenburg region in the period predictively
https://doi.org/10.36233/0372-9311-2019-2-30-36Abstract
Aim. To analyze the epidemiological situation of rotavirus infection in the Orenburg region, taking into account the manifestations of the epidemic process and the molecular genetic characteristics of rotavirus group. Materials and methods. We рresented the results of epidemiological and molecular genetic monitoring of rotavirus infection in the period 2013-2017. Molecular genetic typing was performed in 232 fecal samples of patients under 3 years of age with rotavirus infection. Were used methods of retrospective epidemiological analysis, ELISA, PCR. Results. The incidence of high tear and had a tendency to increase. The most affected were children under 14 years of age. The genetic potential of the rotavirus population in the region was represented by ten main genotypes. The leading significance in the epidemic process were genotypes with the highest frequency of occurrence: G4[P]8 (56,9%), G9[P]8 (12,9%), Mixt (8,6%), G2[P]4 (7,7%), G1[P]8 (6,5%). Conclusion. Were revealed a significant increase in the incidence of rotavirus infection among children. Were revealed the dominant genotypes of rotaviruses, their regional diversity and change during several seasons.
References
1. Dukhovlinov I.V., Bogomolova E.G., Fedorova E.A., Simbirtsev A.S. Geneticheskie i antigennye varianty rotavirusa cheloveka, tsirkuliruyushchie na Evropeiskoi territorii Rossii. Infektsiya i immunitet.2014, 4(3):229-234.
2. Zhirakovskaya, E.V., Aksanova R.Kh, Gorbunova M.G. i dr. Geneticheskoe raznoobrazie izolyatov rotavirusov gruppy A, vyyavlennykh v Zapadnoi Sibiri v 2007-2011 gg. Molekulyarnaya genetika, mikrobiologiya i virusologiya.2012, 4:33-41.
3. Zaitseva E.V., Ol'neva T.A., Kuleshov K.V., Podkolzin A.T., Shipulin G.A. i dr. Rezul'taty monitoringa antigennykh tipov rotavirusov gr.A na territorii Rossiiskoi Federatsii v period 2011-2015 gg. Klinicheskaya laboratornaya diagnostika. 2016, 61(7) 445-448.
4. Kriger E.A., Samodova O.V., Nazarenko S.Yu. Vnutribol'nichnaya rotavirusnaya infektsiya u detei. Infektsionnye bolezni. 2013, 11(3):62-65.
5. Litvinchuk O.A., Konovalova T.A., Podkolzin A.T., Gorelov A.V., Shipulin G.A. Nozokomial'nye kishechnye infektsii v infektsionnykh otdeleniyakh detskikh statsionarov. Molekulyarnaya diagnostika. 2014, 2(12):413-415.
6. Ploskireva A.A. Ostrye kishechnye infektsii virusnoi etiologii u detei: klinika, diagnostika i terapiya. Avtoreferat diss. dokt. med. nauk. M, 2016.
7. Podkolzin A.T. Epidemiologicheskaya i klinicheskaya kharakteristika ostrykh kishechnykh infektsii virusnoi etiologii v Rossiiskoi Federatsii. Avtoref. diss. dokt. med. nauk. M., 2015.
8. Lanata C.F. Child Health Epidemiology Reference Group of the World Health Organization and UNICEF Global causes of diarrheal disease mortality in children younger 5 years of age: a systematic review. PLoS One. 2013, 8(9): e72788.
9. Lozano R., Naghavi M., Foreman K. Global and regional mortality from 235 causes of death for 20 age groups in 1990 and 2010: a systematic analysis for the Global Burden of Disease Study 2010. Lancet.2013;380(9859):2095-2128.
10. Mandal S., Mandal M.D. Is Rotavirus Gastroenteritis a Global Emerging. Re-Emerg Probl. Transl. Med. 2014, 4(143):2161-1025.
11. Parashar U.D., Gibson C.J., Bresee J.S. et al. Rotavirus and severe childhood diarrhea. Emerg.Infect. Dis. 2006, 12:304-306.
12. Vesicari T., Hemming M., Huhti L. et al. Rotavirus antigenemia in children is associated with more severe clinical manifestations of acute gastroenteritis. Pediatr. Infect. Dis. J. 2014, 33(4):366-371.
