РЕТРОСПЕКТИВНЫЙ АНАЛИЗ БИОЛОГИЧЕСКИХ СВОЙСТВ КОЛЛЕКЦИОННЫХ ШТАММОВ FRANCISELLA TULARENSIS, ВЫДЕЛЕННЫХ НА ЮГЕ СИБИРИ (1950 - 2015 ГГ.)

Статья в Elpub

Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2017; : 3-9

РЕТРОСПЕКТИВНЫЙ АНАЛИЗ БИОЛОГИЧЕСКИХ СВОЙСТВ КОЛЛЕКЦИОННЫХ ШТАММОВ FRANCISELLA TULARENSIS, ВЫДЕЛЕННЫХ НА ЮГЕ СИБИРИ (1950 - 2015 ГГ.)

Балахонов С. В., Кулихалова Е. С., Мазепа А. В., Сынгеева А. К., Осmяк А. С., Михайлов Е. П., Ешелкин И. И., Шестаков В. А.

https://doi.org/10.36233/0372-9311-2017-4-3-9

Аннотация

Цель. Исследование таксономической принадлежности коллекционных штаммов возбудителя туляремии на основе протеометрического и молекулярно-генетического методов идентификации. Материалы и методы. В работе использовано 23 штамма туляремийного микроба, изолированных в Красноярском крае и Республике Алтай с 1950 по 2015 гг. Для культивирования возбудителя использовался FT-arap. Спектры для время-пролетной масс-спектрометрии собирались на приборе Microflex LT (Bruker Daltonics, Германия) и анализировались в сравнении с предварительно дополненной базой данных программы MALDI Biotyper 3.0. ПЦР со специфическими праймерами проводилась с электрофоретической визуализацией результатов и в режиме реального времени. Результаты. Установлено, что штаммы F. tuiarensis, выделенные на юге западной Сибири с 1950 до 2010 гг., относятся к подвиду holarctica, из них 56,3% - эритромицин-чувствительные (1 биовар Ery^s), остальные - эритромицин-резистентные (II биовар Ery^R). Семь штаммов, изолированных после 2011 г., по цитруллинуреидазной активности, расщеплению глицерина и наличию фрагментов pdpA и pdpD острова патогенности (FPI) определены как среднеазиатский подвид. Заключение. Результаты ретроспективного исследования биологических свойств штаммов F. tuiarensis, выделенных на юге Сибири, показало отсутствие в коллекции Иркутского противочумного института до 2011 г. возбудителя туляремии среднеазиатского подвида. Обнаружение указанного подвида на территории Российской Федерации свидетельствует о необходимости изучения и анализа вопросов эпидемиологии, экологии и эпизоотологии возбудителя туляремии среднеазиатского подвида, а также определения границ его распространения.

Список литературы

1. Арутюнов Ю.И., Мишанькин Б.Н., Водопьянов А.С. Туляремия в Казахстане. Эпидемиология и инфекционные болезни. 2009, 3: 40-46.

2. Балахонов С.В., Миронова Л. В., Афанасьев М. В., КуликаловаЕ.С., Остяк А.С. MALDI- ToF масс-спектрометрическое определение видовой принадлежности патогенов в совершенствовании эпидемиологического надзора за опасными инфекционными болезнями. Бактериология. 2016, 1 (1): 88-94.

3. КудрявцеваТ.Ю., Транквилевский Д.В., Мокриевич А.Н., Попов В.П., Морозова Н.С., Зароченцев М.В., Мазепа А.В., Окунев Л.П., Холин А.В., Косилко С.А., Федоров Ю.М., Храмов М.В., Дятлов И.А. Эпизоотическая и эпидемическая ситуации по туляремии в Российской Федерации в 2015 г. и прогноз на 2016 г. Проблемы особо опасных инфекций. 2016, 1: 28-32.

4. Куница Т.Н., Избанова У.А., Мека-Меченко В.Г., Майканов Н.С., Садовская В.П. Эпизоотическая активность природных очагов туляремии Казахстана на приграничной с Россией территории. Дальневосточный журнал инфекционной патологии. 2014, 25: 63-65.

5. Лабораторная диагностика опасных инфекционных болезней. Практическое руководство. Г.Г. Онищенко, В.В. Кутырев (ред.). М., Шико, 2013.

6. Мокриевич А.Н., Тимофеев В.С., Кудрявцева Т.Ю., Уланова Г.И., Карбышева С.Б., Миронова Р.И., Вахрамеева Г.М., Губарева Т.И., Павлов В.М., Дятлов И.А. Выделение среднеазиатского подвида туляремийного микроба на территории Алтайского края. Проблемы особо опасных инфекций. 2013, 1: 66-69.

7. Long G.W., Oprandy J.J., Narayanan R.B. et al. Detection of Francisella tularensis in blood by polymerase chain reaction. J. Clin. Microbiol. 1993, 31 (1): 152-154.

8. Nano F.E., Zhang N., Cowley S.C. et al. A Francisella tularensis pathogenicity island required for intramacrophage growth. J. Bacteriol. 2004, 186: 6430-6436.

Journal of microbiology, epidemiology and immunobiology. 2017; : 3-9

RETROSPECTIVE ANALYSIS OF BIOLOGICAL PROPERTIES OF FRANCISELLA TULARENSIS COLLECTION STRAINS ISOLATED IN SOUTH SIBERIA (1950 -2015)

Balakhonov S. V., Kulikalova E. S., Mazepa A. V., Syngeeva A. K., Ostyak A. S., Mikhailov E. P., Eshelkin I. I., Shestakov V. A.

https://doi.org/10.36233/0372-9311-2017-4-3-9

Abstract

Aim. Study taxonomic belonging of collection strains of tularemia causative agent based on proteomic and molecular-genetic methods of identification. Materials and methods. 23 strains of tularemia were used in the study, isolated from Krasnoyarsk region and Altai Republic from 1950 to 2015. FT-agar was used for the cultivation. Spectra for time-of-flight mass-spectrometry were collected using Microflex LT (Bruker Daltonics, Germany) and analyzed compared with previously collected enhanced database of MALDI Biotyper 3.0. PC R with specific primers was carried out with electrophoretic visualization of results in real time. Results. F. tularensis strains isolated from south of western Siberia from 1950 to 2010 were established to belong to subspecies holarctica, and 56.3% of those - erythromycin sensitive (1 biovar Ery^s), the rest - erythromycin-resistant (II biovar Ery^R). 7 strains isolated after 2011 by citrulline ureidase activity, cleavage of glycerin and presence of pdpA and pdpD fragments of pathogenicity island (FP1) were determined as Central Asian subspecies. Conclusion. Results of a retrospective study of biological properties of tularensis strains isolated from south Siberia have shown the lack of Central Asian subspecies tularemia causative agent in the collection of Irkutsk Institute for Plague Control before 2011. Detection of this subspecies in Russian Federation gives evidence on the necessity to study and analyze problems of epidemiology, ecology and epizootology of Central Asian subspecies tularemia causative agent as well as determination of borders of its spread.

References

1. Arutyunov Yu.I., Mishan'kin B.N., Vodop'yanov A.S. Tulyaremiya v Kazakhstane. Epidemiologiya i infektsionnye bolezni. 2009, 3: 40-46.

2. Balakhonov S.V., Mironova L. V., Afanas'ev M. V., KulikalovaE.S., Ostyak A.S. MALDI- ToF mass-spektrometricheskoe opredelenie vidovoi prinadlezhnosti patogenov v sovershenstvovanii epidemiologicheskogo nadzora za opasnymi infektsionnymi boleznyami. Bakteriologiya. 2016, 1 (1): 88-94.

3. KudryavtsevaT.Yu., Trankvilevskii D.V., Mokrievich A.N., Popov V.P., Morozova N.S., Zarochentsev M.V., Mazepa A.V., Okunev L.P., Kholin A.V., Kosilko S.A., Fedorov Yu.M., Khramov M.V., Dyatlov I.A. Epizooticheskaya i epidemicheskaya situatsii po tulyaremii v Rossiiskoi Federatsii v 2015 g. i prognoz na 2016 g. Problemy osobo opasnykh infektsii. 2016, 1: 28-32.

4. Kunitsa T.N., Izbanova U.A., Meka-Mechenko V.G., Maikanov N.S., Sadovskaya V.P. Epizooticheskaya aktivnost' prirodnykh ochagov tulyaremii Kazakhstana na prigranichnoi s Rossiei territorii. Dal'nevostochnyi zhurnal infektsionnoi patologii. 2014, 25: 63-65.

5. Laboratornaya diagnostika opasnykh infektsionnykh boleznei. Prakticheskoe rukovodstvo. G.G. Onishchenko, V.V. Kutyrev (red.). M., Shiko, 2013.

6. Mokrievich A.N., Timofeev V.S., Kudryavtseva T.Yu., Ulanova G.I., Karbysheva S.B., Mironova R.I., Vakhrameeva G.M., Gubareva T.I., Pavlov V.M., Dyatlov I.A. Vydelenie sredneaziatskogo podvida tulyaremiinogo mikroba na territorii Altaiskogo kraya. Problemy osobo opasnykh infektsii. 2013, 1: 66-69.

7. Long G.W., Oprandy J.J., Narayanan R.B. et al. Detection of Francisella tularensis in blood by polymerase chain reaction. J. Clin. Microbiol. 1993, 31 (1): 152-154.

8. Nano F.E., Zhang N., Cowley S.C. et al. A Francisella tularensis pathogenicity island required for intramacrophage growth. J. Bacteriol. 2004, 186: 6430-6436.