Журналов:     Статей:        

Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2017; : 74-80

РАСПРОСТРАНЕНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКИХ МАРКЕРОВ РЕЗИСТЕНТНОСТИ К АНТИБИОТИКАМ У БИОПЛЕНКО-ФОРМИРУЮЩИХ ШТАММОВ ОБЛИГАТНЫХ И ФАКУЛЬТАТИВНЫХ АНАЭРОБОВ

Царев В. Н., Ипполитов Е. В., Николаева Е. Н.

https://doi.org/10.36233/0372-9311-2017-2-74-80

Аннотация

Цель. Сравнительный анализ частоты выявления генетических маркеров устойчивости к антибиотикам, формирующейся у анаэробных бактерий в условиях смешанных биопленок в клинических условиях, и сравнение данных фенотипических и генотипических методов исследования. Материалы и методы. Исследовали 66 штаммов бактерий, образующих биопленку, у которых определяли гены резистентности к антибиотикам с помощью ПЦР: Streptococcus sanguinis, Streptococcus salivarius, Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis, Enterococcus faecalis, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa, и анаэробных патогенов - Porphyromonas gin-givalis, Tannerella forsythia, Parvinonas micra, Prevotella intermedia. Проводили моделирование микробных биопленок in vitro и сканирующую электронную микроскопию. Результаты. Установлено, что исследуемые штаммы резидентной и патогенной микробиоты имеют гены, кодирующие устойчивость к ^-лактамным антибиотикам, карба-пенемам, макролидам, тетрациклинам. В результате ПЦР у штаммов выявлены генетические маркеры устойчивости к р-лактамным антибиотикам (STX-M и МЕСА - цефалоспорины), включая карбапенемы (VIM и NDM, но не Окса-48), гликопептиды (VanA и VanB ), макролидам (ERM), тетрациклину (Tet) и плазмиды QNRB - фторхинолонов. Заключение. Наиболее часто используемые в стоматологической практике препараты - метронидазол и линкомицин (за последние 20 - 30 лет) показали наибольшее число резистентных штаммов - 52,3 и 22,7% соответственно. Частота выявления генетических маркеров резистентности к другим изученным препаратам не превышала 2,5 - 11,4%. Минимальное количество резистентных штаммов анаэробных бактерий выявлено к карбапенемам и фторхинолонам.
Список литературы

1. Диденко Л.В., Автандилов Г.А., Ипполитов Е.В., Царева Е.В., Смирнова Т.А., Шевлягина Н.В., Царев В.Н. Формирование биопленок на стоматологических полимерных материалах как основа персистенции микроорганизмов при патологии зубов и пародонта. Эндодонтия Today. 2015, 4: 13-17.

2. Ипполитов Е.В. Мониторинг формирования микробной биопленки и оптимизация диагностики воспалительных заболеваний пародонта. Автореф. дисс. д.м.н. М., 2016.

3. Прямчук С.Д., Фурсова Н.К., Абаев И.В., Иванова Д.В., Сидоренко С.В., Светоч Э.А., Дятлов И.А. Генетические детерминанты устойчивости к антибактериальным средствам в нозокомиальных штаммах Escherichia coli, Klebsiella spp. и Enterobacter spp., выделенных в России в 2003-2007 гг. Антибиот, и химиотер. 2010, 55 (9-10): 3-10.

4. Царев В.Н. Лабораторная диагностика анаэробной (неклостридиальной) инфекции. В: Руководство по медицинской микробиологии. Под ред. А.С.Лабинской, Н.Н.Костюковой. М., Бином, 2013.

5. Чеботарь И.В., Маянский А.Н., Кончакова Е.Д. Нейтрофилы и бактериальные биопленки: диалектика взаимоотношений. Журн. микробиол. 2013, 6: 105-112.

6. Baroud М., Dandache L, Araj G.F. et al. Underlying mechanisms ofcarbapenem resistance in extended-spectrum р-lactamase-producing Klebsiella pneumoniae and Escherichia coli isolates at a tertiary care centre in Lebanon: role of OXA-48 and NDM-1 carbapen-emases. Int. J. Antimicrob. Agents. 2013 Jan; 41 (1): 75-79.

7. Flamm R.K. et al. Summary of ceftaroline activity against pathogens in the United States, 2010: report from the Assessing Worldwide Antimicrobial Resistance Evaluation (AWARE) surveillance program. Antimicrob. Agents. Chemother. 2012 Jun; 56 (6): 2933-2940.

8. Fursova N.K., Astashkin. E.I., Knyazeva A.I., Kartsev N.N., Leonova E.S., Ershova O.N., Alexandrova I.A., Kurdyumova N.V., Sazikina S.Y., Volozhantsev N.V., Svetoch E.A., Dyatlov I.A. The spread of blaOXA-48 and blaOXA-244 carbapenemase genes among Klebsiella pneumoniae, Proteus mirabilis and Enterobacter spp. isolated in Moscow, Russia. Ann. Clin. Microbiol. Antimicrob. 2015, 14 (1): 46.

9. Lebeaux D., Chauhan A., Rendueles O., Beloin C. From in vitro to in vivo models of bacterial biofilm-related infections pathogens. 2013. 2: 288-356.

Journal of microbiology, epidemiology and immunobiology. 2017; : 74-80

PREVALENCE OF GENETIC MARKERS OF RESISTANCE TO ANTIBIOTICS IN BIOFILM-FORMING STRAINS OF OBLIGATE AND ELECTIVE ANAEROBES

Tsarev V. N., Ippolitov E. V., Nikolaeva E. N.

https://doi.org/10.36233/0372-9311-2017-2-74-80

Abstract

Aim. Comparative study of frequency of detection of genetic markers of resistance to antibiotics forming in anaerobic bacteria under the conditions of mixed biofilms in a clinical setting and comparison of data of phenotypic and genotypic methods of study. Materials and methods. 66 strains of bacteria forming biofilm with PCR detection of antibiotics were studied: Streptococcus sanguinis, Streptococcus salivarius, Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis, Enterococcus faecalis, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa and anaerobic pathogens - Porphyromonas gingivalis, Tannerella forsythia, Parvinonas micra, Prevotella intermedia. Modelling of microbial biofilms in vitro and scanning electron microscopy were carried out. Results. The studied strains of resident and pathogenic microbiota were established to have genes that code resistance to P-lactam antibiotics, carbapenems, macrolides, tetracyclines. Genetic markers of resistance to p-lactam antibiotics (STX-M и МЕСА - cepha-losporines), including carbapenems (VIM and NDM, but not Oxa-48), glycopeptides (VanA and VanB), macrolides (ERM), tetracycline (Tet) and QNRB plasmids (fluoroquinolones) were detected in strains by PCR. Conclusion. The most frequently used preparations in dental practice - metronidazole and lincomycin (for the last 20 - 30 years) have shown the highest number of resistant strains - 52.3 and 22.7%, respectively. The frequency of detection of genetic markers of resistance to other studied preparations did not exceed 2.5 - 11.4%. Minimal quantity of resistant strains of anaerobic bacteria was detected for carbapenems and fluoroquinolones.
References

1. Didenko L.V., Avtandilov G.A., Ippolitov E.V., Tsareva E.V., Smirnova T.A., Shevlyagina N.V., Tsarev V.N. Formirovanie bioplenok na stomatologicheskikh polimernykh materialakh kak osnova persistentsii mikroorganizmov pri patologii zubov i parodonta. Endodontiya Today. 2015, 4: 13-17.

2. Ippolitov E.V. Monitoring formirovaniya mikrobnoi bioplenki i optimizatsiya diagnostiki vospalitel'nykh zabolevanii parodonta. Avtoref. diss. d.m.n. M., 2016.

3. Pryamchuk S.D., Fursova N.K., Abaev I.V., Ivanova D.V., Sidorenko S.V., Svetoch E.A., Dyatlov I.A. Geneticheskie determinanty ustoichivosti k antibakterial'nym sredstvam v nozokomial'nykh shtammakh Escherichia coli, Klebsiella spp. i Enterobacter spp., vydelennykh v Rossii v 2003-2007 gg. Antibiot, i khimioter. 2010, 55 (9-10): 3-10.

4. Tsarev V.N. Laboratornaya diagnostika anaerobnoi (neklostridial'noi) infektsii. V: Rukovodstvo po meditsinskoi mikrobiologii. Pod red. A.S.Labinskoi, N.N.Kostyukovoi. M., Binom, 2013.

5. Chebotar' I.V., Mayanskii A.N., Konchakova E.D. Neitrofily i bakterial'nye bioplenki: dialektika vzaimootnoshenii. Zhurn. mikrobiol. 2013, 6: 105-112.

6. Baroud M., Dandache L, Araj G.F. et al. Underlying mechanisms ofcarbapenem resistance in extended-spectrum r-lactamase-producing Klebsiella pneumoniae and Escherichia coli isolates at a tertiary care centre in Lebanon: role of OXA-48 and NDM-1 carbapen-emases. Int. J. Antimicrob. Agents. 2013 Jan; 41 (1): 75-79.

7. Flamm R.K. et al. Summary of ceftaroline activity against pathogens in the United States, 2010: report from the Assessing Worldwide Antimicrobial Resistance Evaluation (AWARE) surveillance program. Antimicrob. Agents. Chemother. 2012 Jun; 56 (6): 2933-2940.

8. Fursova N.K., Astashkin. E.I., Knyazeva A.I., Kartsev N.N., Leonova E.S., Ershova O.N., Alexandrova I.A., Kurdyumova N.V., Sazikina S.Y., Volozhantsev N.V., Svetoch E.A., Dyatlov I.A. The spread of blaOXA-48 and blaOXA-244 carbapenemase genes among Klebsiella pneumoniae, Proteus mirabilis and Enterobacter spp. isolated in Moscow, Russia. Ann. Clin. Microbiol. Antimicrob. 2015, 14 (1): 46.

9. Lebeaux D., Chauhan A., Rendueles O., Beloin C. From in vitro to in vivo models of bacterial biofilm-related infections pathogens. 2013. 2: 288-356.