Распространённость возбудителей ОРВИ, гриппа и COVID-19 у лиц без симптомов респираторной инфекции

Статья в Elpub

Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2021; 98: 383-396

Распространённость возбудителей ОРВИ, гриппа и COVID-19 у лиц без симптомов респираторной инфекции

Яцышина С. Б., Мамошина М. В., Елькина М. А., Шарухо Г. В., Распопова Ю. И., Фольмер А. Я., Агапов К. А., Владимиров И. М., Зубарева О. В., Новикова И. С., Бондарева О. Б., Гиль В. А., Козловских Д. Н., Романов С. В., Диконская О. В., Пономарева А. В., Чистякова И. В., Кочнева Н. И., Юровских А. И., Кадникова Е. П., Килячина А. С., Лучинина С. В., Косарева Р. Р., Чиркова Г. Г., Валеуллина Н. Н., Лебедева Л. А., Детковская Т. Н., Аббасова Е. И., Романова О. Б., Пятырова Е. В., Акимкин В. Г.

https://doi.org/10.36233/0372-9311-152

Аннотация

Введение. В распространении SARS-CoV-2 могут участвовать инфицированные, у которых отсутствуют или слабо выражены симптомы острой респираторной инфекции (ОРИ). Мониторинг с использованием методов амплификации нуклеиновых кислот позволяет определить распространённость возбудителей ОРИ и оценить эффективность профилактических мер.

Цели — определить распространённость возбудителей ОРИ вирусной этиологии, гриппа и COVID-19 среди лиц без симптомов ОРИ в возрастных группах, проследить изменение эпидемической ситуации путём мониторинга в еженедельном режиме возбудителей в межэпидемический и в начале традиционного эпидемического сезона ОРИ, оценить эффективность медицинских масок для профилактики этих инфекций.

Материалы и методы. С августа по октябрь 2020 г. в 26 регионах РФ обследовано с анкетированием 14 119 лиц (из них 4582 детей), не имевших симптомов ОРИ. Мазки из носо-ротоглотки тестировали наборами реагентов «АмплиСенс ОРВИ-скрин-FL», «АмплиСенс Influenza virus A/B-FL» и «АмплиСенс Cov-Bat-FL» (ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва).

Результаты. Положительные результаты были получены в 11,1% исследованных образцов, превалировал риновирус (7,32%), SARS-CoV-2 обнаружен у 1,66%. Осенью доля случаев инфицирования SARS-CoV-2 выросла с 0,49 до 4,02% (p < 0,001). Концентрация РНК SARS-CoV-2 составляла до 1010 копий в 1 мл образца.

Выводы. Установлены различия распространённости SARS-CoV-2 и риновируса в возрастных группах и в динамике. Применение медицинских масок снижало риск инфицирования респираторными вирусами на 51%, риск заражения SARS-CoV-2 — на 34%. Для обеспечения более эффективной защиты при продолжительном контакте с больным COVID-19 здоровым лицам необходимо использовать респиратор. Лица, чья профессия связана с высоким уровнем социальных контактов, инфицировались реже, чем лица этой же возрастной группы (p = 0,001), что подтверждает действенность противоэпидемических мер и приверженность к их соблюдению людьми, чья профессия связана с частыми социальными контактами.

Список литературы

1. Oran D.P., Topol E.J. Prevalence of asymptomatic SARS-CoV-2 infection: A narrative review. Ann. Intern. Med. 2020; 173(5): 362–7. https://doi.org/10.1093/alcalc/agu083

2. He W., Yi G.Y., Zhu Y. Estimation of the basic reproduction number, average incubation time, asymptomatic infection rate, and case fatality rate for COVID‐19: Meta‐analysis and sensitivity analysis. J. Med. Virol. 2020; 92(11): 2543–50. https://doi.org/10.1002/jmv.26041

3. Kumar M., Taki K., Gahlot R., Sharma A., Dhangar K. A chro- nicle of SARS-CoV-2: Part-I — epidemiology, diagnosis, pro-gnosis, transmission and treatment. Sci. Total Environ. 2020; 734: 139278. https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2020.139278

4. Xiao F., Tang M., Zheng X., Liu Y., Li X., Shan H. Evidence for gastrointestinal infection of SARS-CoV-2. Gastroenterology. 2020; 158(6): 1831–3.e3. https://doi.org/10.1053/j.gastro.2020.02.055

5. Койчубеков Б.К., Сорокина М.А., Мхитарян К.Э. Определение размера выборки при планировании научного исследования. Международный журнал прикладных и фундаментальных исследований. 2014; (4): 71–4.

6. Liang M., Gao L., Cheng C., Zhou Q., Uy J.P., Heiner K., et al. Efficacy of face mask in preventing respiratory virus trans-mission: A systematic review and meta-analysis. Travel Med. Infect. Dis. 2020; 36: 101751. https://doi.org/10.1016/j.tmaid.2020.101751

7. Ueki H., Furusawa Y., Iwatsuki-Horimoto K., Imai M., Kaba-ta H., Nishimura H., et al. Effectiveness of face masks in pre-venting airborne transmission of SARS-CoV-2. mSphere. 2020; 5(5): e00637-20. https://doi.org/10.1128/mSphere.00637-20

Journal of microbiology, epidemiology and immunobiology. 2021; 98: 383-396

Prevalence of ARVI, influenza, and COVID-19 pathogens in individuals without symptoms of respiratory infection

Yatsyshina S. B., Mamoshina M. V., Elkina M. A., Sharukho G. V., Raspopova Yu. I., Folmer А. Ya., Agapov K. A., Vladimirov I. M., Zubareva O. V., Novikova I. S., Bondareva O. B., Gil V. A., Kozlovskikh D. N., Romanov S. V., Dikonskaya O. V., Ponomareva A. V., Chistyakova I. V., Kochneva N. I., Yurovskikh A. I., Kadnikova E. P., Kilyachina A. S., Luchinina S. V., Kosareva R. R., Chirkova G. G., Valeullina N. N., Lebedeva L. A., Detkovskaya T. N., Abbasova E. I., Romanova O. B., Pyatyrova E. V., Akimkin V. G.

https://doi.org/10.36233/0372-9311-152

Abstract

Introduction. SARS-CoV-2 can be transmitted by infected people without or with mild symptoms of acute respira-tory infection (ARI). Monitoring based on nucleic acid amplification techniques is used to measure the prevalence of ARI pathogens and to assess the effectiveness of preventive measures.

The aim is to measure the prevalence of pathogens causing ARIs of viral etiology, influenza, and COVID-19 among individuals without ARI symptoms throughout age groups, to trace changes in the epidemic situation by weekly monitoring pathogens during the inter-epidemic period and at the beginning of a typical ARI epidemic season, to assess the effectiveness of medical masks for prevention of the above infections.

Materials and methods. A total of 14,119 people (including 4,582 children) without ARI symptoms went through examination, including questionnaire surveys, in 26 regions of Russia from August to October 2020. Nasopharyn-geal and oropharyngeal swabs were tested by using AmpliSens ARVI-screen-FL, AmpliSens Influenza virus A/B-FL, and AmpliSens Cov-Bat-FL reagent kits (The Central Research Institute of Epidemiology of Rospotrebnadzor, Moscow).

Results. 11.1% of the tested samples showed positive results; the rhinovirus prevailed (7.32%), while SARS-CoV-2 was detected in 1.66%. In autumn, the proportion of SARS-CoV-2 infected cases increased from 0.49% to 4.02% (p < 0.001). The SARS-CoV-2 RNA concentration was up to 1010 copies/mL.

Conclusions. Differences in the prevalence of SARS-CoV-2 and rhinovirus among the age groups and over time were found and analyzed. Using of medical masks reduced the risk of infection with respiratory viruses and with SARS-CoV-2 by 51% and 34%, respectively. In case of prolonged exposure to a COVID-19 patient, healthy people must use a respirator for more effective protection. The individuals whose work was associated with a high level of social contacts were infected more rarely than other individuals in the same age group (p = 0.001); this fact supports the importance of anti-epidemic measures and commitment to their adherence by people whose profession entails frequent social contacts.

References

1. Oran D.P., Topol E.J. Prevalence of asymptomatic SARS-CoV-2 infection: A narrative review. Ann. Intern. Med. 2020; 173(5): 362–7. https://doi.org/10.1093/alcalc/agu083

4. Xiao F., Tang M., Zheng X., Liu Y., Li X., Shan H. Evidence for gastrointestinal infection of SARS-CoV-2. Gastroenterology. 2020; 158(6): 1831–3.e3. https://doi.org/10.1053/j.gastro.2020.02.055

5. Koichubekov B.K., Sorokina M.A., Mkhitaryan K.E. Opredelenie razmera vyborki pri planirovanii nauchnogo issledovaniya. Mezhdunarodnyi zhurnal prikladnykh i fundamental'nykh issledovanii. 2014; (4): 71–4.