ИДЕНТИФИКАЦИЯ ВОЗБУДИТЕЛЕЙ САПА И МЕЛИОИДОЗА НА ОСНОВЕ ПРИНЦИПОВ ПОЛИФАЗНОГО ТАКСОНОМИЧЕСКОГО ПОДХОДА

Статья в Elpub

Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2016; : 25-34

ИДЕНТИФИКАЦИЯ ВОЗБУДИТЕЛЕЙ САПА И МЕЛИОИДОЗА НА ОСНОВЕ ПРИНЦИПОВ ПОЛИФАЗНОГО ТАКСОНОМИЧЕСКОГО ПОДХОДА

Корсакова И. И., Антонов В. А., Храпова Н. П., Замарина Т. В., Пименова Е. В., Ким Е. Э., Меринова Л. К., Сенина Т. В., Ткаченко Г. А., Савченко С. С., Агеева Н. П., Молчанова Е. В., Лопастейская Я. А., Прохватилова Е. В.

https://doi.org/10.36233/0372-9311-2016-6-25-34

Аннотация

Цель. Определить оптимальный набор наиболее эффективных методов идентификации и внутривидового типирования возбудителей сапа и мелиоидоза. Материалы и методы. Использованы бактериологические, иммунохимические, молекулярно-генетические методы. Результаты. Изучена возможность идентификации коллекционных штаммов патогенных и близкородственных буркхольдерий в полуавтоматических системах. Разработаны способы выявления информативных вариабельных участков геномов указанных микроорганизмов, выбраны методы их генетического типирования. Установлена эффективность применения преципитирующих МКА для дифференциации буркхольдерий. Обобщены данные о диагностических возможностях иммуноглобулинов, флуоресцирующих на основе моноклональных антител различной эпитопной направленности, для обнаружения и идентификации В. mallei и В. pseudomallei. Созданы экспериментальные серии амплификационных тест-систем для идентификации возбудителей сапа и мелиоидоза в формате ПЦР в режиме реального времени. Заключение. Предложен ряд методов идентификации и типирования возбудителей сапа и мелиоидоза.

Список литературы

1. Жога Л.К., Илюхин В.И., Самыгин В.М. Транспортная среда для патогенных псевдомонад. Клиническая лабораторная диагностика. 1995, 1: 38-40.

2. Мазин А.В., Кузнеделов К.Д., Краев А.С., Холодилов Н.Г. Методы молекулярной генетики и генной инженерии. Новосибирск, Наука, Сиб. отделение, 1990.

3. Онищенко Г.Г., Кутырев В.В. Лабораторная диагностика опасных инфекционных болезней. Практическое руководство. М., Шико, 2013.

4. Прохватилова Е. В., Антонов В.А., Викторов Д. В., Храпова Н. П., Ткаченко Г. А., Илюхин В.И., Захарова И.Б., Гришина М.А., Плеханова Н.Г., Новицкая И.В., Кулаков М.Я., Булатова Т.В., Корсакова И.И., Савченко С.С., Бондарева О.С., Тетерятникова Н.Н., Сенина Т.В., Лопастейская Я.А., Батурин А.А., Куликова А.С. Сравнительная оценка информативности иммунологических и молекулярно-генетических методов и средств на этапах специфической индикации возбудителя мелиоидоза. Клиническая лабораторная диагностика. 2014, 12: 55-59.

5. Ряпис Л.А., Илюхин В.И., Вострова Е.И., Джузенов А. А. Лабораторная диагностика клинически значимых видов псевдомонад. Лаб. дело. 1988,12: 66-71.

6. Ряпис Л.А., Тарасова Т.Д. Перспективы применения хромосомной трансформации для идентификации возбудителей мелиоидоза. Журн. микробиол. 1988, 8: 16-19.

7. Храпова Н. П., Алексеев В. В., Корсакова И. И., Дрефс Н ,М., Ломова Л. В., Булатова Т. В., Напалкова Г.М. Применение сапных и мелиоидозных моноклональных антител различной эпитопной направленности для обнаружения и идентификации патогенных буркхольдерий. Проблемы особо опасных инфекций. 2011, 107: 66-69.

8. Anuntagool N., Panichakul Т, Aramsri Р. et al. Shedding of lipopolysaccaride and 200-kDa suface antigen during the in vitro growth of virulent Ara- and avirulent Ara+ Burkholderia pseudomallei. Acta tropica. 2000, 74: 221-228.

9. Duangsonk K., Gal D., Mayo M. et al. Use of a variable amplicon typing scheme reveals considerable variation in the accessory genomes of isolates of Burkholderia pseudomallei. J. Clin. Microbiol. 2006, 44: 1323-1334.

10. Goding J.W. Monoclonal antibodies: principles and practice. Acad. Press, 1986.

11. Kim H.Y., Tsai S., Lo S.C. et al. Production and characterization of chimeric monoclonal antibodies against Burkholderia pseudomallei and B. mallei using the DHFR expression system. PLoS one. 2011, 5: el9867.

12. Shelly D.B., Spilker X, Gracely E.J. Utility of commercial systems for identification of Burkholderia cepacia complex from cystic fibrosis sputum culture. J. Clin. Microbiol. 2000, 38:3112-3115.

13. Tomaso H., Scholz H.C., Al Dahouk S. et al. Development of 5-nuclease real-time PCRassays for the rapid identification of the Burkholderia mallei/Burkholderia pseudomallei complex. Diagn. Mol. Pathgl. 2004,13: 247-253.

14. U'Ren J.M., Schupp J.M., Pearson T. et al. Tandem repeat regions within the Burkholderia pseudomallei genome and their application for high resolution genotyping. BMC Microbiol. 2007, 1: 7-23.

15. Vandamme P. Polyphasic taxonomy in practice: the Burkholderia cepacia challenge. WFCC Newsletter. 2002, 34:17-24.

Journal of microbiology, epidemiology and immunobiology. 2016; : 25-34

IDENTIFICATION OF CAUSATIVE AGENTS OF GLANDERS AND MELIOIDOSIS BASED ON PRINCIPLES OF POLYPHASE TAXONOMIC APPROACH

Korsakova I. I., Antonov V. A., Khrapova N. P., Zamarina T. V., Pimenova E. V., Kim E. E., Merinova L. K., Senina T. V., Tkachenko G. A., Savchenko S. S., Ageeva N. P., Molchanova E. V., Lopasteiskaya Ya. A., Prokhvatilova E. V.

https://doi.org/10.36233/0372-9311-2016-6-25-34

Abstract

Aim. Determine an optimal set of the most effective methods of identification and intraspecies typing of causative agents of glanders and melioidosis. Materials and methods. Bacteriologic, immunochemical, molecular-genetic methods were used. Results. A possibility to identify collection strains of pathogenic and closely related Burkholderia in semiautomatic systems is studied. Means of detection of informative variable genome segments of the specified microorganisms were developed, methods of their genetic typing were selected. Effectiveness of application of precipitating mAbs for differentiation of Burkholderia was established. Data on diagnostic possibilities of immunoglobulins fluorescing based on monoclonal antibodies of various etiotropic directionality for detection and identification of B. mallei and B. pseudomallei are generalized. Experimental series of amplification test-systems for identification of glanders and melioidosis causative agents in real-time PCR format are created. Conclusion. A number of methods for identification and typing of glanders and melioidosis causative agents is proposed.

References

1. Zhoga L.K., Ilyukhin V.I., Samygin V.M. Transportnaya sreda dlya patogennykh psevdomonad. Klinicheskaya laboratornaya diagnostika. 1995, 1: 38-40.

2. Mazin A.V., Kuznedelov K.D., Kraev A.S., Kholodilov N.G. Metody molekulyarnoi genetiki i gennoi inzhenerii. Novosibirsk, Nauka, Sib. otdelenie, 1990.

3. Onishchenko G.G., Kutyrev V.V. Laboratornaya diagnostika opasnykh infektsionnykh boleznei. Prakticheskoe rukovodstvo. M., Shiko, 2013.

4. Prokhvatilova E. V., Antonov V.A., Viktorov D. V., Khrapova N. P., Tkachenko G. A., Ilyukhin V.I., Zakharova I.B., Grishina M.A., Plekhanova N.G., Novitskaya I.V., Kulakov M.Ya., Bulatova T.V., Korsakova I.I., Savchenko S.S., Bondareva O.S., Teteryatnikova N.N., Senina T.V., Lopasteiskaya Ya.A., Baturin A.A., Kulikova A.S. Sravnitel'naya otsenka informativnosti immunologicheskikh i molekulyarno-geneticheskikh metodov i sredstv na etapakh spetsificheskoi indikatsii vozbuditelya melioidoza. Klinicheskaya laboratornaya diagnostika. 2014, 12: 55-59.

5. Ryapis L.A., Ilyukhin V.I., Vostrova E.I., Dzhuzenov A. A. Laboratornaya diagnostika klinicheski znachimykh vidov psevdomonad. Lab. delo. 1988,12: 66-71.

6. Ryapis L.A., Tarasova T.D. Perspektivy primeneniya khromosomnoi transformatsii dlya identifikatsii vozbuditelei melioidoza. Zhurn. mikrobiol. 1988, 8: 16-19.

7. Khrapova N. P., Alekseev V. V., Korsakova I. I., Drefs N ,M., Lomova L. V., Bulatova T. V., Napalkova G.M. Primenenie sapnykh i melioidoznykh monoklonal'nykh antitel razlichnoi epitopnoi napravlennosti dlya obnaruzheniya i identifikatsii patogennykh burkkhol'derii. Problemy osobo opasnykh infektsii. 2011, 107: 66-69.

8. Anuntagool N., Panichakul T, Aramsri R. et al. Shedding of lipopolysaccaride and 200-kDa suface antigen during the in vitro growth of virulent Ara- and avirulent Ara+ Burkholderia pseudomallei. Acta tropica. 2000, 74: 221-228.

10. Goding J.W. Monoclonal antibodies: principles and practice. Acad. Press, 1986.

12. Shelly D.B., Spilker X, Gracely E.J. Utility of commercial systems for identification of Burkholderia cepacia complex from cystic fibrosis sputum culture. J. Clin. Microbiol. 2000, 38:3112-3115.

14. U'Ren J.M., Schupp J.M., Pearson T. et al. Tandem repeat regions within the Burkholderia pseudomallei genome and their application for high resolution genotyping. BMC Microbiol. 2007, 1: 7-23.

15. Vandamme P. Polyphasic taxonomy in practice: the Burkholderia cepacia challenge. WFCC Newsletter. 2002, 34:17-24.