Особенности этиологии внебольничных пневмоний, ассоциированных с COVID-19
https://doi.org/10.21055/0370-1069-2020-4-99-105
Аннотация
Цель исследования – сравнительное изучение этиологической структуры внебольничных пневмоний у SARSCoV-2 «+» и SARS-CoV-2 «-» больных, обратившихся за помощью в медицинские организации Ростовской области.
Материалы и методы. Исследовали биологический материал (мазки из носоглотки и мокроту) от 508 пациентов с диагнозом «внебольничная пневмония», находившихся на амбулаторном лечении или в стационарах г. Ростова-на-Дону. Верификация респираторных вирусов, включая РНК SARS-CoV-2, а также M. pneumoniae, C. pneumoniae, L. pneumophila выполнена методом полимеразной цепной реакции в мазках носоглотки (n=508). Бактериологический анализ мокроты проводили с использованием дифференциально-диагностических сред, идентификацию выделенных патогенов осуществляли с помощью времяпролетной масс-спектрометрии на приборе Autoflex (Bruker Daltonics, Германия) c программным обеспечением BioTyper 3,0.
Результаты и обсуждение. В период распространения новой коронавирусной инфекции в Ростовской области основным этиологическим агентом внебольничных пневмоний является новый коронавирус SARS-CoV-2. Особенностью внебольничных пневмоний (ВП) у пациентов с лабораторно подтвержденным COVID-19 является более высокая частота микстинфекций как вирусной, так и бактериальной этиологии. На фоне выявления у пациентов с ВП РНК SARS-CoV-2 зарегистрированы случаи обнаружения коронавирусов других типов (HKU-1, OC43, HL-63 или 229Е). Наиболее часто этиологическим агентом ВП бактериальной природы являлись бактерии рода Streptococcus как у пациентов с ВП, ассоциированной с COVID-19, так и у пациентов с отрицательным результатом на SARS-CoV-2. Коронавирусные больные представляют группу высокого риска по развитию микотических поражений легких.
Ключевые слова
Об авторах
А. Ю. ПоповаРоссия
127994, Москва, Вадковский переулок, дом 18, строение 5 и 7;
125993, Москва, ул. Баррикадная, 2/1
Е. Б. Ежлова
Россия
127994, Москва, Вадковский переулок, дом 18, строение 5 и 7
Ю. В. Демина
Россия
127994, Москва, Вадковский переулок, дом 18, строение 5 и 7;
125993, Москва, ул. Баррикадная, 2/1
А. К. Носков
Россия
344002, Ростов-на-Дону, ул. М. Горького, 117/40
Е. В. Ковалев
Россия
Ростов-на-Дону, 344109, ул. 18-я линия, 17
О. С. Чемисова
Россия
344002, Ростов-на-Дону, ул. М. Горького, 117/40
Т. И. Твердохлебова
Россия
Ростов-на-Дону
Н. В. Павлович
Россия
344002, Ростов-на-Дону, ул. М. Горького, 117/40
С. О. Водопьянов
Россия
344002, Ростов-на-Дону, ул. М. Горького, 117/40
М. В. Цимбалистова
Россия
344002, Ростов-на-Дону, ул. М. Горького, 117/40
Н. Е. Гаевская
Россия
344002, Ростов-на-Дону, ул. М. Горького, 117/40
С. Ф. Воловикова
Россия
344002, Ростов-на-Дону, ул. М. Горького, 117/40
С. И. Стенина
Россия
344002, Ростов-на-Дону, ул. М. Горького, 117/40
Е. Н. Гудуева
Россия
344002, Ростов-на-Дону, ул. М. Горького, 117/40
М. М. Сагакянц
Россия
344002, Ростов-на-Дону, ул. М. Горького, 117/40
А. В. Алешукина
Россия
С. С. Слись
Россия
Ростов-на-Дону, 344109, ул. 18-я линия, 17
Список литературы
1. Чучалин А.Г., Синопальников А.И., Козлов Р.С., Авдеев С.Н., Тюрин И.Е., Руднов В.А., Рачина С.А., Фесенко О.В. Клинические рекомендации по диагностике, лечению и профилактике тяжелой внебольничной пневмонии у взрослых. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2015; 17(2):84–126.
2. Рачина С.А., Бобылев А.А. Атипичные возбудители внебольничной пневмонии: от эпидемиологии к особенностям диагностики и лечения. Практическая пульмонология. 2016; 2:20–7.
3. Рачина С.А., Иванчик Н.В., Козлов Р.С. Особенности микробиологической диагностики при внебольничной пневмонии у взрослых. Практическая пульмонология. 2016; 4:40–7.
4. Du Toit A. Measles increases the risk of other infections. Nat. Rev. Microbiol. 2019; 18(1):2. DOI: 10.1038/s41579-019-0301-7.
5. Zahariadis G., Gooley T.A., Ryall P., Hutchinson C., Latchford M.I., Fearon M.A., Jamieson F.B., Richardson S., Kuschak T., Mederski B. Risk of ruling out severe acute respiratory syndrome by ruling in another diagnosis: variable incidence of atypical bacteria coinfection based on diagnostic assays. Can. Respir. J. 2006; 13(1):17–22. DOI: 10.1155/2006/862797.
6. Arabi Y.M., Al-Omari A., Mandourah Y., Al-Hameed F., Sindi A.A., Alraddadi B., Shalhoub S., Almotairi A., Al Khatib K., Abdulmomen A., Qushmaq I., Mady A., Solaiman O., Al-Aithan A.M., Al-Raddadi R., Ragab A., Al Mekhlafi G.A., Al Harthy A., Kharaba A., Ahmadi M.A., Sadat M., Mutairi H.A., Qasim E.A., Jose J., Nasim M., Al-Dawood A., Merson L., Fowler R., Hayden F.G., Balkhy H.H. Critically ill patients with the Middle East respiratory syndrome: a multicenter retrospective cohort study. Crit. Care Med. 2017; 45:1683–95. DOI: 10.1097/CCM.0000000000002621.
7. Zhou Y., Guo S., He Y., Zuo Q., Liu D., Xiao M., Fan J., Li X. COVID-19 is distinct from SARS-CoV-2-negative community-acquired pneumonia. Front. Cell. Infect. Microbiol. 2020; 10:322. DOI: 10.3389/fcimb.2020.00322.
8. Lai C.-C., Wang C.-Y., Hsueh P.-R. Co-infections among patients with COVID-19: The need for combination therapy with non-anti-SARS-CoV-2 agents? J. Microbiol. Immunol. Infect. 2020; 53(4):505–12. DOI: 10.1016/j.jmii.2020.05.013.
9. Chen N., Zhou M., Dong X., Qu J., Gong F., Han Y., Qiu Y., Wang J., Liu Y., Wei Y., Xia J., Yu T., Zhang X., Zhang L. Epidemiological and clinical characteristics of 99 cases of 2019 novel coronavirus pneumonia in Wuhan, China: a descriptive study. Lancet. 2020; 395(10223):507–13. DOI: 10.1016/S0140-6736(20)30211-7.
10. Стулова М.В., Кудряшева И.А., Полунина О.С., Черенова Л.П., Аршба Т.Е., Лисина О.А., Казакова Е.А. Сравнительный клинико-лабораторный анализ COVID-19 ассоциированной пневмонии с внебольничной пневмонией бактериальной этиологии. Современные проблемы науки и образования. 2020; 3. DOI: 10.17513/spno.29905.
Рецензия
Для цитирования:
Попова А.Ю., Ежлова Е.Б., Демина Ю.В., Носков А.К., Ковалев Е.В., Чемисова О.С., Твердохлебова Т.И., Павлович Н.В., Водопьянов С.О., Цимбалистова М.В., Гаевская Н.Е., Воловикова С.Ф., Стенина С.И., Гудуева Е.Н., Сагакянц М.М., Алешукина А.В., Слись С.С. Особенности этиологии внебольничных пневмоний, ассоциированных с COVID-19. Проблемы особо опасных инфекций. 2020;(4):99-105. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2020-4-99-105
For citation:
Popova A.Yu., Ezhlova E.B., Demina Yu.V., Noskov A.K., Kovalev E.V., Chemisova O.S., Tverdokhlebova T.I., Pavlovich N.V., Vodop’yanov S.O., Tsimbalistova M.V., Gaevskaya N.E., Volovikova S.V., Stenina S.I., Gudueva E.N., Sagakyants M.M., Aleshukina A.V., Slis’ S.S. Features of Etiology of Community-Acquired Pneumonia Associated with COVID-19. Problems of Particularly Dangerous Infections. 2020;(4):99-105. (In Russ.) https://doi.org/10.21055/0370-1069-2020-4-99-105